RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 SLC34A2O95436 690 aa25.5■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 PSMC4P43686 418 aa25.5■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.5■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 SRRDQ9UH36 339 aa25.5■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.49■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 MS4A1P11836 297 aa25.49■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.49■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.49■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 FLT1P17948 1338 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM75PA6NK02 468 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 OSBPP22059 807 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 CAP2P40123 477 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 HOXD10P28358 340 aa25.47■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.47■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.47■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
UBXN4-204ENST00000426921 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 FCGRTP55899 365 aa25.45■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.45■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.45■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.45■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 MYPNQ86TC9 1320 aa25.44■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 CERS3Q8IU89 383 aa25.44■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.44■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 DNAJC18Q9H819 358 aa25.44■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 MGAMO43451 1857 aa25.44■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 SPP2Q13103 211 aa25.43■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 TREML2Q5T2D2 321 aa25.43■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 AACSQ86V21 672 aa25.43■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 PNMA3Q9UL41 463 aa25.43■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.43■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 USP17L5A8MUK1 530 aa25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 CYP7A1P22680 504 aa25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 GRK4P32298 578 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 PRKCZQ05513 592 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 RAET1EQ8TD07 263 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 WDR18Q9BV38 432 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 GINM1Q9NU53 330 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 ASNSP08243 561 aa25.4■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.4■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 PALD1Q9ULE6 856 aa25.4■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.4■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 HMGCS2P54868 508 aa25.39■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 MAP3K12Q12852 859 aa25.39■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.39■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.39■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.39■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.39■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 COG6Q9Y2V7 657 aa25.39■■□□□ 1.66
UBXN4-204ENST00000426921 HMMRO75330 724 aa25.38■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 JAG1P78504 1218 aa25.38■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.38■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 HLA-DOAP06340 250 aa25.37■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 MTFR1Q15390 333 aa25.37■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.37■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 SLAIN1Q8ND83 568 aa25.37■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.37■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 GABRQQ9UN88 632 aa25.37■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 BACE1P56817 501 aa25.36■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.36■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.36■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.36■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
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