RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421202.5

CCDC18-AS1-205, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC18-AS1, Length 2,973 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NDUFB5O43674 189 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 USP48Q86UV5 1035 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NARFQ9UHQ1 456 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 STARD3NLO95772 234 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HMOX1P09601 288 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TERF1P54274 439 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RSPH1Q8WYR4 309 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 JADE2Q9NQC1 790 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 COL19A1Q14993 1142 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LMNB1P20700 586 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PLCB3Q01970 1234 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM210AQ96ND0 272 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TNFRSF10BO14763 440 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GYS1P13807 737 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KCNQ4P56696 695 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF790Q6PG37 636 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CYLDQ9NQC7 956 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HOXB7P09629 217 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FLT3P36888 993 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IL17REQ8NFR9 667 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF358Q9NW07 568 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 OPLAHO14841 1288 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CCDC172P0C7W6 258 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TGFB3P10600 412 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PTK2Q05397 1052 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 COX20Q5RI15 118 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZBTB33Q86T24 672 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 COL15A1P39059 1388 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ERICH4A6NGS2 130 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HAX1O00165 279 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RFC4P35249 363 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IRS1P35568 1242 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TEFQ10587 303 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NFE2L2Q16236 605 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NBPF3Q9H094 633 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ESPNB1AK53 854 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CAPN2P17655 700 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CD151P48509 253 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 BRICD5Q6PL45 260 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LGR6Q9HBX8 967 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GGT7Q9UJ14 662 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NPR3P17342 541 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SKAP1Q86WV1 359 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HSCBQ8IWL3 235 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM129BQ96TA1 746 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms