RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419249.2

AGRN-202, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 3

Gene AGRN, Length 861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-202ENST00000419249 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
AGRN-202ENST00000419249 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.08■■□□□ 1.13
AGRN-202ENST00000419249 PALD1Q9ULE6 856 aa22.08■■□□□ 1.13
AGRN-202ENST00000419249 PDE4AP27815 886 aa22.07■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 TM4SF4P48230 202 aa22.07■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 INHBEP58166 350 aa22.07■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 TTC6Q86TZ1 520 aa22.07■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 EHD4Q9H223 541 aa22.07■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.06■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.06■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 OPTNQ96CV9 577 aa22.06■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.06■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 GJA5P36382 358 aa22.05■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 LBX1P52954 281 aa22.05■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 PPATQ06203 517 aa22.05■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 SREBF2Q12772 1141 aa22.05■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.05■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.05■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.05■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.05■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 GNAT2P19087 354 aa22.04■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 PPIL2Q13356 520 aa22.04■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 RNF186Q9NXI6 227 aa22.04■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.04■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.04■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 MYH1P12882 1939 aa22.04■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 GPAA1O43292 621 aa22.03■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 PRKAB2O43741 272 aa22.03■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 SLURP2P0DP57 97 aa22.03■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.03■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 DNAJC18Q9H819 358 aa22.03■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 GINM1Q9NU53 330 aa22.03■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.03■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 SIPA1L1O43166 1804 aa22.02■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.02■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 CAP2P40123 477 aa22.02■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 GTF2A2P52657 109 aa22.02■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 OTUD5Q96G74 571 aa22.02■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.02■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.02■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 PICK1Q9NRD5 415 aa22.02■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.02■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 TSKSQ9UJT2 592 aa22.02■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
AGRN-202ENST00000419249 M0R2C6 588 aa22.01■■□□□ 1.11
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AGRN-202ENST00000419249 PLCD1P51178 756 aa22.01■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 GABPAQ06546 454 aa22.01■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.01■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.01■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 FAM196BA6NMK8 535 aa22■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 GSG1L2A8MUP6 293 aa22■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 PTPRAP18433 802 aa22■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 TTC22Q5TAA0 569 aa22■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 TATDN1Q6P1N9 297 aa22■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 AMOTL1Q8IY63 956 aa22■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 RILPL2Q969X0 211 aa22■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22■■□□□ 1.11
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AGRN-202ENST00000419249 CXCL11O14625 94 aa21.99■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 IRF6O14896 467 aa21.99■■□□□ 1.11
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AGRN-202ENST00000419249 C12orf60Q5U649 245 aa21.99■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.99■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 USP17L12C9JPN9 530 aa21.98■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 USP17L21D6R901 530 aa21.98■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 HIP1O00291 1037 aa21.98■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 ASNSP08243 561 aa21.98■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 CETPP11597 493 aa21.98■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 SNAPC2Q13487 334 aa21.98■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.98■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 DOCK1Q14185 1865 aa21.98■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 SDSP20132 328 aa21.97■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.97■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.97■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 CTR9Q6PD62 1173 aa21.97■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 IFNL1Q8IU54 200 aa21.97■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 SWAP70Q9UH65 585 aa21.97■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.97■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.97■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 SHMT1P34896 483 aa21.96■■□□□ 1.11
AGRN-202ENST00000419249 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.96■■□□□ 1.11
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