RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTA-202ENST00000399409 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
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RABGGTA-202ENST00000399409 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.57■■□□□ 1.84
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RABGGTA-202ENST00000399409 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
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RABGGTA-202ENST00000399409 COL4A1P02462 1669 aa26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-202ENST00000399409 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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RABGGTA-202ENST00000399409 CALM3P0DP25 149 aa26.5■■□□□ 1.83
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RABGGTA-202ENST00000399409 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
RABGGTA-202ENST00000399409 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.49■■□□□ 1.83
RABGGTA-202ENST00000399409 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.49■■□□□ 1.83
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RABGGTA-202ENST00000399409 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
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