RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM34Q9BYJ4 488 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PALD1Q9ULE6 856 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPRYD7Q5W111 196 aa18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCM9Q9NXL9 1143 aa18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SERPINB13Q9UIV8 391 aa18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPDYE5A6NIY4 337 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SDSP20132 328 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRM1Q13255 1194 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERO1BQ86YB8 467 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GINM1Q9NU53 330 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DOCK2Q92608 1830 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0R2C6 588 aa18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRKAB2O43741 272 aa18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCYL3Q8IZE3 742 aa18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WNK4Q96J92 1243 aa18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEP350Q5VT06 3117 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INPP5BP32019 993 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INHBEP58166 350 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPATQ06203 517 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SREBF2Q12772 1141 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OPTNQ96CV9 577 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELP3Q9H9T3 547 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PICK1Q9NRD5 415 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GSG1L2A8MUP6 293 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AOC2O75106 756 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GABPAQ06546 454 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SBK1Q52WX2 424 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SWAP70Q9UH65 585 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYH2Q9UKX2 1941 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP17L12C9JPN9 530 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP17L21D6R901 530 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CA12O43570 354 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAP2P40123 477 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLCD1P51178 756 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLCB2Q00722 1185 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPIL2Q13356 520 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C12orf60Q5U649 245 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TATDN1Q6P1N9 297 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM227BQ96M60 508 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJC18Q9H819 358 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0D9SFI3 127 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APPP05067 770 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASNSP08243 561 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTF2A2P52657 109 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTR9Q6PD62 1173 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WBP1LQ9NX94 342 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM196BA6NMK8 535 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPRAP18433 802 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TM4SF4P48230 202 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TDO2P48775 406 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OTUD5Q96G74 571 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAPBQ9H115 298 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC171Q6TFL3 1326 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAD50Q92878 1312 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CXCL11O14625 94 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GJA5P36382 358 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNAPC2Q13487 334 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALX1Q15699 326 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF287Q9HBT7 754 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNH4Q9UQ05 1017 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZMYM6O95789 1325 aa18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IRF6O14896 467 aa18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAPN15O75808 1086 aa18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLURP2P0DP57 97 aa18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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