RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395713.6

TRPS1-202, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-202ENST00000395713 GRK4P32298 578 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 ADGRE1Q14246 886 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 MBTPS1Q14703 1052 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 KRBA1A5PL33 1030 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 ATE1O95260 518 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 PLCG1P19174 1290 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 ASPAP45381 313 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 PREPP48147 710 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 TTLL4Q14679 1199 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 Q6ZS46 218 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 RNF214Q8ND24 703 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 HMGXB3Q12766 1538 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 FANCGO15287 622 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 HTR3BO95264 441 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 PGRP06401 933 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 PDE4BQ07343 736 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 CEP41Q9BYV8 373 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 STK17AQ9UEE5 414 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-202ENST00000395713 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 NEFMP07197 916 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 NTF4P34130 210 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 ETFBP38117 255 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 CHRNA4P43681 627 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 UBXN4Q92575 508 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 SHDQ96IW2 340 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 DCAF5Q96JK2 942 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 PIDD1Q9HB75 910 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 USP11P51784 963 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 CD163Q86VB7 1156 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 ISL2Q96A47 359 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 CRBNQ96SW2 442 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 FBRSQ9HAH7 460 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 DNAJA2O60884 412 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 IMPDH2P12268 514 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 GIPRP48546 466 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 ARMC5Q96C12 935 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 KLHL3Q9UH77 587 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 RAB6AP20340 208 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 MLECQ14165 292 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 NKG7Q16617 165 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 SGO2Q562F6 1265 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 HID1Q8IV36 788 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-202ENST00000395713 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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