RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP2B6P20813 491 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMGCS2P54868 508 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAP3K10Q02779 954 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 PICALMQ13492 652 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPR153Q6NV75 609 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP38Q8NB14 1042 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRIQ9BWK5 157 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 NBPF3Q9H094 633 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRANK1O15050 2925 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL16Q14005 1332 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 RHBDL3P58872 404 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPP2Q13103 211 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 LHX8Q68G74 356 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 PI16Q6UXB8 463 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYLIPQ8WY64 445 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 SIL1Q9H173 461 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 PORCNQ9H237 461 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAST3O60307 1309 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF16BQ96L93 1317 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 BTDP43251 543 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 RASGRF1Q13972 1273 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q3C1V9 767 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP6NLQ92738 828 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 COA7Q96BR5 231 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 HOOK2Q96ED9 719 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 IDI2Q9BXS1 227 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP44Q9H0E7 712 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAJC18Q9H819 358 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 PICK1Q9NRD5 415 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF236Q9UL36 1845 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 EYA2O00167 538 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 ENTPD3O75355 529 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTMR2Q13614 643 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 SHHQ15465 462 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATP2B3Q16720 1220 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRPV1Q8NER1 839 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNMDO75829 334 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 GDF11O95390 407 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC5A1P13866 664 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 EPHB4P54760 987 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 MECOMQ03112 1051 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 MORN1Q5T089 497 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANO1Q5XXA6 986 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.77□□□□□ -1.32
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL9A1P20849 921 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITGB8P26012 769 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 HERVK_113P62684 666 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC102BQ68D86 513 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 LPIN2Q92539 896 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms