RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 MPNDQ8N594 471 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 EVI5LQ96CN4 794 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ANO10Q9NW15 660 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 DACT1Q9NYF0 836 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 AP5Z1O43299 807 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 COPS2P61201 443 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ECM1Q16610 540 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 TTC6Q86TZ1 520 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 BICD2Q8TD16 824 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 KAT6BQ8WYB5 2073 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SURF6O75683 361 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SKILP12757 684 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ATP1A2P50993 1020 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SEC13P55735 322 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 GLI3P10071 1580 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0G2JS52 829 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 FAM177BA6PVY3 158 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 F6X3S4 739 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 KCNJ4P48050 445 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 G2E3Q7L622 706 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PIGBQ92521 554 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 SPSB2Q99619 263 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ECHDC1Q9NTX5 307 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM51Q9NW97 253 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ICMTO60725 284 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 STARD3NLO95772 234 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 NECTIN1Q15223 517 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM50Q86XT4 487 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF592Q92610 1267 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TULP2O00295 520 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 MYO1BO43795 1136 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 KINO60870 393 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 NR1I2O75469 434 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 LIG1P18858 919 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CYP2C19P33261 490 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TUBB4BP68371 445 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 LRMPQ12912 555 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 MTX1Q13505 466 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CTR9Q6PD62 1173 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 KSR2Q6VAB6 950 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TICAM2Q86XR7 235 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 SIX5Q8N196 739 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 BPIFA3Q9BQP9 254 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 USP44Q9H0E7 712 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ATG3Q9NT62 314 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TLL1O43897 1013 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
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