RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 BAG3O95817 575 aa9.34□□□□□ -0.91
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SGMS1-201ENST00000361543 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.34□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.34□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 BCL11AQ9H165 835 aa9.34□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 PICK1Q9NRD5 415 aa9.34□□□□□ -0.91
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SGMS1-201ENST00000361543 MAP3K10Q02779 954 aa9.33□□□□□ -0.92
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SGMS1-201ENST00000361543 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.33□□□□□ -0.92
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SGMS1-201ENST00000361543 CAP1Q01518 475 aa9.29□□□□□ -0.92
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF6Q15052 776 aa9.29□□□□□ -0.92
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SGMS1-201ENST00000361543 C17orf99Q6UX52 265 aa9.28□□□□□ -0.92
SGMS1-201ENST00000361543 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SGMS1-201ENST00000361543 HAUS7Q99871 368 aa9.28□□□□□ -0.92
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.28□□□□□ -0.92
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.28□□□□□ -0.92
SGMS1-201ENST00000361543 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.28□□□□□ -0.92
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