RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359957.7

BRMS1-201, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRMS1, Length 1,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-201ENST00000359957 STAP2Q9UGK3 403 aa17.59■□□□□ 0.41
BRMS1-201ENST00000359957 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
BRMS1-201ENST00000359957 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa17.59■□□□□ 0.41
BRMS1-201ENST00000359957 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
BRMS1-201ENST00000359957 MBD4O95243 580 aa17.58■□□□□ 0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ALDH1A1P00352 501 aa17.58■□□□□ 0.41
BRMS1-201ENST00000359957 GTF2A2P52657 109 aa17.58■□□□□ 0.41
BRMS1-201ENST00000359957 PPATQ06203 517 aa17.58■□□□□ 0.41
BRMS1-201ENST00000359957 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
BRMS1-201ENST00000359957 PALD1Q9ULE6 856 aa17.58■□□□□ 0.41
BRMS1-201ENST00000359957 SALL3Q9BXA9 1300 aa17.58■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 MYH1P12882 1939 aa17.58■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 TM4SF4P48230 202 aa17.57■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 MAP3K10Q02779 954 aa17.57■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 PPIL2Q13356 520 aa17.57■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 SCYL3Q8IZE3 742 aa17.57■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 LCORLQ8N3X6 602 aa17.57■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 ARMT1Q9H993 441 aa17.57■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 NAV1Q8NEY1 1877 aa17.57■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 TRPA1O75762 1119 aa17.56■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 APPBP2Q92624 585 aa17.56■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 EVI5LQ96CN4 794 aa17.56■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa17.56■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 RNF186Q9NXI6 227 aa17.56■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 LAMB1P07942 1786 aa17.56■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 PHF20L1A8MW92 1017 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 LBX1P52954 281 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 SNAPC2Q13487 334 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 MCM9Q9NXL9 1143 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 SERPINB13Q9UIV8 391 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 DOCK1Q14185 1865 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 FAM196BA6NMK8 535 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 CETPP11597 493 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 SDR42E1Q8WUS8 393 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 PRDM10Q9NQV6 1147 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 TSKSQ9UJT2 592 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa17.55■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa17.54■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 GJA5P36382 358 aa17.54■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 CCL15Q16663 113 aa17.54■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 IFNL1Q8IU54 200 aa17.54■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 EHD4Q9H223 541 aa17.54■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 IRF6O14896 467 aa17.53■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 GNAT2P19087 354 aa17.53■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 CAP2P40123 477 aa17.53■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 SLFNL1Q499Z3 407 aa17.53■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 TBC1D2Q9BYX2 928 aa17.53■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 ZHX2Q9Y6X8 837 aa17.53■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 CHGBP05060 677 aa17.52■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 ASNSP08243 561 aa17.52■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 PTPRAP18433 802 aa17.52■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 PDE4AP27815 886 aa17.52■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 TICAM2Q86XR7 235 aa17.52■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa17.52■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 RILPL2Q969X0 211 aa17.52■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 OSBPL3Q9H4L5 887 aa17.52■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 AS3MTQ9HBK9 375 aa17.52■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 GINM1Q9NU53 330 aa17.52■□□□□ 0.4
BRMS1-201ENST00000359957 ATAD5Q96QE3 1844 aa17.52■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 CXCL11O14625 94 aa17.51■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 GPAA1O43292 621 aa17.51■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 APPP05067 770 aa17.51■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 SLURP2P0DP57 97 aa17.51■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 OSBP2Q969R2 916 aa17.51■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 MS4A4AQ96JQ5 239 aa17.51■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 BACH2Q9BYV9 841 aa17.51■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.51■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 SIPA1L1O43166 1804 aa17.51■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 PRKAB2O43741 272 aa17.5■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 NACAP1Q9BZK3 213 aa17.5■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 KCNH4Q9UQ05 1017 aa17.5■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 USP17L5A8MUK1 530 aa17.49■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP17.49■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 PLCD1P51178 756 aa17.49■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 GIMAP6Q6P9H5 292 aa17.49■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 BRI3BPQ8WY22 251 aa17.49■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 CABP5Q9NP86 173 aa17.49■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 SWAP70Q9UH65 585 aa17.49■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 TRIM75PA6NK02 468 aa17.48■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 TBC1D8O95759 1140 aa17.48■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 TDO2P48775 406 aa17.48■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
BRMS1-201ENST00000359957 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms