RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358966.6

GGPS1-202, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GGPS1, Length 2,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-202ENST00000358966 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.75□□□□□ -0.05
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GGPS1-202ENST00000358966 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.75□□□□□ -0.05
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GGPS1-202ENST00000358966 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.69□□□□□ -0.06
GGPS1-202ENST00000358966 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GGPS1-202ENST00000358966 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.69□□□□□ -0.06
GGPS1-202ENST00000358966 RNF214Q8ND24 703 aa14.69□□□□□ -0.06
GGPS1-202ENST00000358966 ALG1Q9BT22 464 aa14.69□□□□□ -0.06
GGPS1-202ENST00000358966 SCN9AQ15858 1988 aa14.69□□□□□ -0.06
GGPS1-202ENST00000358966 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
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