RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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PRPF39-201ENST00000355765 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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PRPF39-201ENST00000355765 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.47■■□□□ 1.03
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PRPF39-201ENST00000355765 KAT2BQ92831 832 aa21.47■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 A0A087WZG4 1122 aa21.47■■□□□ 1.03
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PRPF39-201ENST00000355765 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.46■■□□□ 1.03
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PRPF39-201ENST00000355765 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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PRPF39-201ENST00000355765 MORC3Q14149 939 aa21.46■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 MCTP2Q6DN12 878 aa21.46■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 MICU3Q86XE3 530 aa21.46■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 EHD4Q9H223 541 aa21.46■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 FBXL16Q8N461 479 aa21.45■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 NCOA7Q8NI08 942 aa21.45■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 SENP2Q9HC62 589 aa21.45■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 MYO6Q9UM54 1294 aa21.45■■□□□ 1.02
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PRPF39-201ENST00000355765 CDC25AP30304 524 aa21.45■■□□□ 1.02
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PRPF39-201ENST00000355765 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.43■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.43■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 ARHGAP25P42331 645 aa21.42■■□□□ 1.02
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PRPF39-201ENST00000355765 KAT14Q9H8E8 782 aa21.42■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
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PRPF39-201ENST00000355765 TRIM29Q14134 588 aa21.42■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 LRRC24Q50LG9 513 aa21.42■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 WDR93Q6P2C0 686 aa21.42■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 GUCA1BQ9UMX6 200 aa21.42■■□□□ 1.02
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PRPF39-201ENST00000355765 ZMYM6O95789 1325 aa21.41■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 MNAT1P51948 309 aa21.41■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 STIM1Q13586 685 aa21.41■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF213O14771 459 aa21.41■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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