RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV5-2P06315 115 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 SDR42E1Q8WUS8 393 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 GNAT2P19087 354 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-201ENST00000348564 USH1GQ495M9 461 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-201ENST00000348564 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
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PTPRC-201ENST00000348564 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 CCPG1Q9ULG6 757 aa5.16□□□□□ -1.58
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PTPRC-201ENST00000348564 NRAPQ86VF7 1730 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa5.16□□□□□ -1.58
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