RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 SEC23AQ15436 765 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 IQCA1Q86XH1 822 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 TCHHQ07283 1943 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 SNED1Q8TER0 1413 aa22.42■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.42■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 ECE2O60344 883 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 CDKL5O76039 1030 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB7AO95365 584 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 DPEP1P16444 411 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 KCNA3P22001 575 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 AOC3Q16853 763 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 GPT2Q8TD30 523 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 FOSBP53539 338 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 RCAN1P53805 252 aa22.39■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 NTRK3Q16288 839 aa22.39■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 NID2Q14112 1375 aa22.39■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.39■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 FLT1P17948 1338 aa22.39■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 NT5C2P49902 561 aa22.39■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 PLCD1P51178 756 aa22.39■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 RESTQ13127 1097 aa22.39■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.39■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.39■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.39■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.39■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 FIBPO43427 364 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 SCNN1DP51172 638 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 CCDC93Q567U6 631 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 DACT2Q5SW24 774 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 USP17L3A6NCW0 530 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 USP17L4A6NCW7 530 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 TSPY2A6NKD2 308 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 MBD3O95983 291 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 KRT85P78386 507 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 TEKT1Q969V4 418 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 C8orf76Q96K31 380 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 RTN1Q16799 776 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 FANCBQ8NB91 859 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 PHKBQ93100 1093 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 PPIP5K2O43314 1243 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 GUCY1B3Q02153 619 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 MTFR1LQ9H019 292 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 NMT2O60551 498 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 POLD1P28340 1107 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 MRIQ9BWK5 157 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 SCN9AQ15858 1988 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 IFNAR1P17181 557 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 TGFB2P61812 414 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 TFAP4Q01664 338 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 PPP2R5BQ15173 497 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 PSMD1Q99460 953 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 USP40Q9NVE5 1235 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 CRKP46108 304 aa22.34■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 RGS22Q8NE09 1264 aa22.34■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.33■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 ALG1Q9BT22 464 aa22.33■■□□□ 1.17
UPP1-201ENST00000331803 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 UBE2HP62256 183 aa22.33■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 PICALMQ13492 652 aa22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms