RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325110.10

HMGCS1-201, Transcript of 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGCS1, Length 3,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1-201ENST00000325110 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
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HMGCS1-201ENST00000325110 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 IKBKBO14920 756 aa14.73□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 PPP6R2O75170 966 aa14.73□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
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HMGCS1-201ENST00000325110 RESP18Q5W5W9 173 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 CSRNP2Q9H175 543 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 FBXO3Q9UK99 471 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 CPDO75976 1380 aa14.72□□□□□ -0.05
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HMGCS1-201ENST00000325110 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 TPM1P09493 284 aa14.72□□□□□ -0.05
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HMGCS1-201ENST00000325110 CLCN6P51797 869 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.052e-7■■■□□ 15.9
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HMGCS1-201ENST00000325110 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 EPSTI1Q96J88 318 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 VSTM4Q8IW00 320 aa14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 SLAIN2Q9P270 581 aa14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 DEXIO95424 95 aa14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 MMP1P03956 469 aa14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 SYCP1Q15431 976 aa14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 FANCBQ8NB91 859 aa14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 TNKSO95271 1327 aa14.71□□□□□ -0.05
HMGCS1-201ENST00000325110 ADAMTS2O95450 1211 aa14.71□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 ESR2Q92731 530 aa14.71□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 MST1RQ04912 1400 aa14.71□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 ARHGAP6O43182 974 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 ATP6V1AP38606 617 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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HMGCS1-201ENST00000325110 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 TIGD1Q96MW7 591 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 BPIFA3Q9BQP9 254 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 IFNAR1P17181 557 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 MTF1Q14872 753 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.7□□□□□ -0.06
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HMGCS1-201ENST00000325110 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 PLIN2Q99541 437 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 MRC1P22897 1456 aa14.7□□□□□ -0.06
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HMGCS1-201ENST00000325110 PPARAQ07869 468 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 SUSD4Q5VX71 490 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 CDC25AP30304 524 aa14.69□□□□□ -0.06
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HMGCS1-201ENST00000325110 WDR24Q96S15 920 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 VPS16Q9H269 839 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 N4BP3O15049 544 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 KCNQ4P56696 695 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.69□□□□□ -0.06
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HMGCS1-201ENST00000325110 KIF20AO95235 890 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 MLKLQ8NB16 471 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 TEX33O43247 280 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 BMP6P22004 513 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 LIFRP42702 1097 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
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