RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 E7EWF7 191 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 NR1I2O75469 434 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 MBD4O95243 580 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 AVPP01185 164 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 CPA1P15085 419 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 MPNDQ8N594 471 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D16Q8TBP0 767 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 CNKSR1Q969H4 720 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC6A16Q9GZN6 736 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 AK9Q5TCS8 1911 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMB2P55268 1798 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 LDHCP07864 332 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTO1P78417 241 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 NFKBIBQ15653 356 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 IFNL3Q8IZI9 196 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 NCOA7Q8NI08 942 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 NAPBQ9H115 298 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 ARMT1Q9H993 441 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 CD209Q9NNX6 404 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 POLLQ9UGP5 575 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 IL1R1P14778 569 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 EYA3Q99504 573 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 COA1Q9GZY4 146 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 C4AP0C0L4 1744 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 SALL1Q9NSC2 1324 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 MCM5P33992 734 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 MECOMQ03112 1051 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 CERS3Q8IU89 383 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 MIGA1Q8NAN2 632 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 TAF6LQ9Y6J9 622 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 ZMYM6O95789 1325 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 GSG1L2A8MUP6 293 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXP2O15409 715 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 BAG3O95817 575 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 TDO2P48775 406 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 HAND2P61296 217 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXC1Q12948 553 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB3GAP1Q15042 981 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZUG5 572 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXL16Q8N461 479 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 GBP4Q96PP9 640 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 AXIN1O15169 862 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 CFHP08603 1231 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 STOX1Q6ZVD7 989 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 LCORLQ8N3X6 602 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 TPCN1Q9ULQ1 816 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDX5P30044 214 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 ME3Q16798 604 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT23Q9C075 422 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 DACH1Q9UI36 760 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA6L22H0YM25 854 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKAB2O43741 272 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 PDCP20941 246 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 PTMSP20962 102 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 PODNQ7Z5L7 613 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC83Q8IWF9 413 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 BRF1Q92994 677 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 TCEANC2Q96MN5 208 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 AGXT2Q9BYV1 514 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR19Q8NEZ3 1342 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms