RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EBAG9O00559 213 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MTF1Q14872 753 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAP9Q49MG5 647 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAI14Q9P0K7 980 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPP6R2O75170 966 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LIG3P49916 1009 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CNPY4Q8N129 248 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 JMYQ8N9B5 988 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDIA6Q15084 440 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLIC6Q96NY7 704 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRDNQ13061 729 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NR1I3Q14994 352 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KAZALD1Q96I82 304 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SUCLG2Q96I99 432 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C5P01031 1676 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DISP2A7MBM2 1401 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDE4BQ07343 736 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SHC4Q6S5L8 630 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC35F6Q8N357 371 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DACH1Q9UI36 760 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GRM8O00222 908 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPFIA3O75145 1194 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCT5P48643 541 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RESP18Q5W5W9 173 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KSR2Q6VAB6 950 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A1B0GTH6 734 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BMP6P22004 513 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDC27P30260 824 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC102BQ68D86 513 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COG1Q8WTW3 980 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF28PB7ZC32 967 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 E7EWF7 191 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C21orf2O43822 256 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AMPD2Q01433 879 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDR1Q08345 913 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MLKLQ8NB16 471 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FECHP22830 423 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 INPP5BP32019 993 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IRAK1P51617 712 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USP14P54578 494 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPFIA1Q13136 1202 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 STIM1Q13586 685 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GBP6Q6ZN66 633 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TICAM2Q86XR7 235 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LINS1Q8NG48 757 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KAT14Q9H8E8 782 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYO6Q9UM54 1294 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GLI3P10071 1580 aa20.21■□□□□ 0.83
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