RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297436.2

DEFA6-201, Transcript of defensin alpha 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DEFA6, Length 469 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6-201ENST00000297436 CYP27B1O15528 508 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 ZBTB43O43298 467 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 BMP15O95972 392 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 CSF1RP07333 972 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 IFNAR1P17181 557 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 ADD2P35612 726 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 PLCD1P51178 756 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 GNG11P61952 73 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 PNOCQ13519 176 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 NR1I3Q14994 352 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 POSTNQ15063 836 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 NTRK3Q16288 839 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 LRRC24Q50LG9 513 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 NBPF14Q5TI25 921 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 NBPF15Q8N660 670 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 SMARCE1Q969G3 411 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 FBXW7Q969H0 707 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 FUT8Q9BYC5 575 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 INTS13Q9NVM9 706 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 RAI14Q9P0K7 980 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 RAB21Q9UL25 225 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 DOCK2Q92608 1830 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 AKAP11Q9UKA4 1901 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 DISP2A7MBM2 1401 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 RIC1Q4ADV7 1423 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 RPS6KA5O75582 802 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 OAS2P29728 719 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 LONRF3Q496Y0 759 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 TMTC2Q8N394 836 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 KRT23Q9C075 422 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 TMEM51Q9NW97 253 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 CDC23Q9UJX2 597 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 CHD4Q14839 1912 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa8.99□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 TMEM232C9JQI7 657 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 NPHP1O15259 732 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 FANCGO15287 622 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 KIF5CO60282 957 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 MMP1P03956 469 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 IVLP07476 585 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 MCM3P25205 808 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 PBX1P40424 430 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 ZAP70P43403 619 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 HAND2P61296 217 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 SEMA3FQ13275 785 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 TCIRG1Q13488 830 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 TRIM14Q14142 442 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 SPATA1Q5VX52 437 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 HDXQ7Z353 690 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 CNGA4Q8IV77 575 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 PARD6BQ9BYG5 372 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 NBPF3Q9H094 633 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 LY9Q9HBG7 655 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 ST7Q9NRC1 585 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
DEFA6-201ENST00000297436 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms