RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295083.7

PQLC3-201, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PQLC3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-201ENST00000295083 HLA-DOAP06340 250 aa29.4■■■□□ 2.3
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PQLC3-201ENST00000295083 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.4■■■□□ 2.3
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PQLC3-201ENST00000295083 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.28
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PQLC3-201ENST00000295083 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.29■■■□□ 2.28
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PQLC3-201ENST00000295083 NF2P35240 595 aa29.28■■■□□ 2.28
PQLC3-201ENST00000295083 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
PQLC3-201ENST00000295083 TSGA10IPQ3SY00 556 aa29.28■■■□□ 2.28
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PQLC3-201ENST00000295083 ZNF287Q9HBT7 754 aa29.24■■■□□ 2.27
PQLC3-201ENST00000295083 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
PQLC3-201ENST00000295083 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
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PQLC3-201ENST00000295083 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
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