RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 ZMYM6O95789 1325 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 HUNKP57058 714 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 ALX1Q15699 326 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 TTC6Q86TZ1 520 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 USP26Q9BXU7 913 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 SIPA1L1O43166 1804 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 HTRA3P83110 453 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 OTOFQ9HC10 1997 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 FGAP02671 866 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 TDO2P48775 406 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 MAP3K11Q16584 847 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 WRNIP1Q96S55 665 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 NAPBQ9H115 298 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 TBC1D12O60347 775 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 KLRG1Q96E93 195 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 USP17L12C9JPN9 530 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 USP17L21D6R901 530 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 FAM196BA6NMK8 535 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 SLURP2P0DP57 97 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 PLCD1P51178 756 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 MAP3K9P80192 1104 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 NECTIN1Q15223 517 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 EHD4Q9H223 541 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 CSADQ9Y600 493 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 RASSF10A6NK89 507 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 CYP2D6P10635 497 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 MAP3K10Q02779 954 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 SBK1Q52WX2 424 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 CTR9Q6PD62 1173 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 MYH8P13535 1937 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 HSPA4P34932 840 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 C12orf60Q5U649 245 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 RGMBQ6NW40 437 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD11-201ENST00000249504 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 UNCXA6NJT0 531 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 INPP5BP32019 993 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJC18Q9H819 358 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 DOCK1Q14185 1865 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 SLC27A2O14975 620 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 CYP21A2P08686 494 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 MCCP23508 829 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 EVX2Q03828 476 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 GRM1Q13255 1194 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 VGLL4Q14135 290 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 KCNB2Q92953 911 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF213O14771 459 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 ECE1P42892 770 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 PPARAQ07869 468 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 RNF20Q5VTR2 975 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 ELP3Q9H9T3 547 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 HAND2P61296 217 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 GABPAQ06546 454 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 CAPNS2Q96L46 248 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 SWAP70Q9UH65 585 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms