RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 SDF4Q9BRK5 362 aa23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 ZNF384Q8TF68 577 aa23.28■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.28■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.28■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 GPSM2P81274 684 aa23.28■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 GUCY1B3Q02153 619 aa23.27■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.27■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 INCENPQ9NQS7 918 aa23.27■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 MMP10P09238 476 aa23.27■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 NBPF11Q86T75 865 aa23.27■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.27■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.27■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.26■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 TERF2Q15554 542 aa23.26■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.26■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.26■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.26■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.26■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.26■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 XDHP47989 1333 aa23.26■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 NRDCO43847 1150 aa23.25■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 SMC2O95347 1197 aa23.25■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 PRDX5P30044 214 aa23.25■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 ADALQ6DHV7 355 aa23.25■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 FAM53CQ9NYF3 392 aa23.25■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.25■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.25■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 A0A1W2PQ27 194 aa23.24■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 A0A1W2PQ64 194 aa23.24■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 A0A1W2PQD8 194 aa23.24■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 TPM4P67936 248 aa23.24■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.24■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.24■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 NAPBQ9H115 298 aa23.24■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 A0A1B0GVL5 298 aa23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 SEMA3EO15041 775 aa23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 TMC6Q7Z403 805 aa23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 PPFIA3O75145 1194 aa23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 NCOA7Q8NI08 942 aa23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 L2HGDHQ9H9P8 463 aa23.23■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 UFL1O94874 794 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 ANTXR2P58335 489 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 MECOMQ03112 1051 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 STK38Q15208 465 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 IFNKQ9P0W0 207 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 PRC1O43663 620 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 BBOX1O75936 387 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 NDUFA8P51970 172 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 DPCR1Q3MIW9 517 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 OLFM4Q6UX06 510 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.22■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.21■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 TUBB4AP04350 444 aa23.21■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 KCNJ6P48051 423 aa23.21■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 ARMCX5Q6P1M9 558 aa23.21■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.21■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 POLLQ9UGP5 575 aa23.21■■□□□ 1.31
VGF-201ENST00000249330 TDO2P48775 406 aa23.2■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 ALX1Q15699 326 aa23.2■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.2■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.2■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.2■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 CACNA1SQ13698 1873 aa23.2■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 SMIM22K7EJ46 135 aa23.2■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms