RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 PPP2R5BQ15173 497 aa19.96■□□□□ 0.79
CLDN11-201ENST00000064724 KRBA2Q6ZNG9 492 aa19.96■□□□□ 0.79
CLDN11-201ENST00000064724 STK11IPQ8N1F8 1099 aa19.96■□□□□ 0.79
CLDN11-201ENST00000064724 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CLDN11-201ENST00000064724 TOMM22Q9NS69 142 aa19.96■□□□□ 0.79
CLDN11-201ENST00000064724 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CLDN11-201ENST00000064724 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CLDN11-201ENST00000064724 CHD4Q14839 1912 aa19.96■□□□□ 0.79
CLDN11-201ENST00000064724 SYCP1Q15431 976 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 SEC23AQ15436 765 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 RILPL1Q5EBL4 403 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF654Q8IZM8 581 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 ANKRD7Q92527 254 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 A0A0G2JS52 829 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 USP27XA6NNY8 438 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 SMC2O95347 1197 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 LONRF3Q496Y0 759 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 CEP135Q66GS9 1140 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC150Q8NCX0 1101 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 PTPREP23469 700 aa19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 PNOCQ13519 176 aa19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 BARGINQ6ZT62 677 aa19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 UBAC1Q9BSL1 405 aa19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 KCNJ14Q9UNX9 436 aa19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 NRAPQ86VF7 1730 aa19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 MYO1BO43795 1136 aa19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 FANCCQ00597 558 aa19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 ESR2Q92731 530 aa19.94■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 COL4A1P02462 1669 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 ADAMTS2O95450 1211 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 GYG1P46976 350 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 KCNJ6P48051 423 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 MYL5Q02045 173 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 CNNM3Q8NE01 707 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 RGL2O15211 777 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 PTPN14Q15678 1187 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 ARMCX5Q6P1M9 558 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 SDR42E1Q8WUS8 393 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 RAI14Q9P0K7 980 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 ABCF2Q9UG63 623 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 TAOK2Q9UL54 1235 aa19.93■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 ERFEQ4G0M1 354 aa19.92■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 ISM2Q6H9L7 571 aa19.92■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 C3orf67Q6ZVT6 689 aa19.92■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 TMC6Q7Z403 805 aa19.92■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC112Q8NEF3 446 aa19.92■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.92■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa19.92■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 MINDY4BA8MYZ0 360 aa19.91■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 FGRP09769 529 aa19.91■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 PCP11498 1178 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 TNKSO95271 1327 aa19.91■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 ATP1A3P13637 1013 aa19.91■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 CAVIN4Q5BKX8 364 aa19.91■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 SLC10A5Q5PT55 438 aa19.91■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 NUP133Q8WUM0 1156 aa19.91■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 MINPP1Q9UNW1 487 aa19.91■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 NR5A1Q13285 461 aa19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 NT5DC1Q5TFE4 455 aa19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC82Q8N4S0 544 aa19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 FUT2Q10981 343 aa19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 OLFM4Q6UX06 510 aa19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 CEP131Q9UPN4 1083 aa19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CLDN11-201ENST00000064724 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CLDN11-201ENST00000064724 CBFA2T2O43439 604 aa19.89■□□□□ 0.77
CLDN11-201ENST00000064724 KCNQ2O43526 872 aa19.89■□□□□ 0.77
CLDN11-201ENST00000064724 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CLDN11-201ENST00000064724 BMP6P22004 513 aa19.89■□□□□ 0.77
CLDN11-201ENST00000064724 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CLDN11-201ENST00000064724 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CLDN11-201ENST00000064724 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
CLDN11-201ENST00000064724 SEMA3EO15041 775 aa19.88■□□□□ 0.77
CLDN11-201ENST00000064724 SARSP49591 514 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms