RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp2r5e	Q61151	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dlx3	Q64205	287 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Morc2a	Q69ZX6	1030 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam167a	Q6P1G6	215 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hltf	Q6PCN7	1003 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Larp1	Q6ZQ58	1072 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fbxo10	Q7TQF2	950 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nrde2	Q80XC6	1172 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gpcpd1	Q8C0L9	675 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q8CC96	669 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfpm2	Q8CCH7	1151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pom121	Q8K3Z9	1200 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Flcn	Q8QZS3	579 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tor1aip1	Q921T2	595 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arih2	Q9Z1K6	492 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc18	Q640L5	1455 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ninj1	O70131	152 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pde8a	O88502	823 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Apex1	P28352	317 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pbxip1	Q3TVI8	727 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lsmem1	Q3UQS2	128 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ubn1	Q4G0F8	1135 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pld6	Q5SWZ9	221 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stip1	Q60864	543 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hsd3b5	Q61694	373 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc40	Q8BI79	1192 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gpr153	Q8K0Z9	631 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eif4a3	Q91VC3	411 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q9CQC3	228 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dbndd1	Q9CZ00	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tomm20	Q9DCC8	145 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ide	Q9JHR7	1019 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sart3	Q9JLI8	962 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tnks	Q6PFX9	1320 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rusc2	Q80U22	1514 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Odf2	A3KGV1	830 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Il13ra1	O09030	424 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Scamp3	O35609	349 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Traf1	P39428	409 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	E2f8	Q58FA4	860 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif5b	Q61768	963 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Serpinb3d	Q6UKZ0	387 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wtip	Q7TQJ8	398 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pramel6	Q810Y9	485 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clasrp	Q8CFC7	668 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pof1b	Q8K4L4	587 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam129b	Q8R1F1	749 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ginm1	Q91WR6	327 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Klhl10	Q9D5V2	608 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dhx29	Q6PGC1	1365 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm36028	A0A0U1RPM1	299 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lzts3	A2AHG0	700 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm13102	A2ASJ3	519 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm4302	E9PX25	294 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Evi5l	H3BKQ3	813 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atp8a2	P98200	1148 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aifm3	Q3TY86	605 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spout1	Q3UHX9	385 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbc1d30	Q69ZT9	766 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbc1d22b	Q80VE5	505 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spidr	Q8BGX7	933 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ralyl	Q8BTF8	293 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Naxe	Q8K4Z3	282 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Glyctk	Q8QZY2	523 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc22a19	Q8VCA0	551 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dhcr24	Q8VCH6	516 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dnajc24	Q91ZF0	196 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ddx27	Q921N6	760 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Xpo5	Q924C1	1204 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Erc1	Q99MI1	1120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kcnq5	Q9JK45	933 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Katna1	Q9WV86	491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrpprc	Q6PB66	1392 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Asxl2	Q8BZ32	1370 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbkbp1	A2A9T0	611 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pabpc4l	G5E8X2	370 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sbk2	P0C5K1	362 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrrn4	P59383	733 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Colgalt2	Q6NVG7	625 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem87a	Q8BXN9	555 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smc4	Q8CG47	1286 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zmat2	Q9CPW7	199 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Luc7l	Q9CYI4	371 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Armc10	Q9D0L7	306 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	1700016D06Rik	Q9DAA5	166 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rad18	Q9QXK2	509 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mamdc4	A2AJA7	1228 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nfil3	O08750	462 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gjd2	O54851	321 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pdgfa	P20033	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stmn1	P54227	149 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Traf6	P70196	530 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pdlim7	Q3TJD7	457 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Esyt1	Q3U7R1	1092 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf496	Q5SXI5	585 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nrros	Q8BMT4	693 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zbtb9	Q8CDC7	459 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hmces	Q8R1M0	353 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pex19	Q8VCI5	299 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mtfr2	Q8VED8	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 173.8 ms