RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	NEB	P20929	6669 aa		1.13	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538	KLK9	Q2XQG4	91 aa		1.12	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	1.12	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	1.11	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538	MUC17	Q685J3	4493 aa		1.11	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538	USH2A	O75445	5202 aa		1.11	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538	C9orf92	A6NGG3	77 aa		1.11	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538	MT1H	P80294	61 aa		1.11	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538	SSPO	A2VEC9	5147 aa		1.1	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538		A8MTW9	85 aa		1.1	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		1.1	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538		H0YAA0	97 aa		1.09	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		1.09	□□□□□ -2.23
EP300-208	ENST00000635538	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		1.07	□□□□□ -2.24
EP300-208	ENST00000635538	PRLH	P81277	87 aa		1.06	□□□□□ -2.24
EP300-208	ENST00000635538	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
EP300-208	ENST00000635538	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		1.05	□□□□□ -2.24
EP300-208	ENST00000635538	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		1.04	□□□□□ -2.24
EP300-208	ENST00000635538	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	1.04	□□□□□ -2.24
EP300-208	ENST00000635538	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		1.04	□□□□□ -2.24
EP300-208	ENST00000635538	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		1.04	□□□□□ -2.24
EP300-208	ENST00000635538	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		1.03	□□□□□ -2.24
EP300-208	ENST00000635538	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		1.03	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		1.02	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	SPRR1A	P35321	89 aa		1.02	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	MT1F	P04733	61 aa		1.01	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		1.01	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	KMT2D	O14686	5537 aa		1	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538		M0QY20	66 aa		1	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	MT2A	P02795	61 aa		1	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	MDN1	Q9NU22	5596 aa		0.99	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	SPRR1B	P22528	89 aa		0.99	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	SPRR2E	P22531	72 aa		0.98	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	SPRR2B	P35325	72 aa		0.98	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	SPRR2A	P35326	72 aa		0.98	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		0.97	□□□□□ -2.25
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		0.96	□□□□□ -2.26
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		0.96	□□□□□ -2.26
EP300-208	ENST00000635538	SPRR2D	P22532	72 aa		0.95	□□□□□ -2.26
EP300-208	ENST00000635538	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		0.95	□□□□□ -2.26
EP300-208	ENST00000635538		A0A0D9SG42	100 aa		0.94	□□□□□ -2.26
EP300-208	ENST00000635538	SPINK1	P00995	79 aa		0.94	□□□□□ -2.26
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		0.94	□□□□□ -2.26
EP300-208	ENST00000635538		S4R3F8	94 aa		0.93	□□□□□ -2.26
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		0.91	□□□□□ -2.26
EP300-208	ENST00000635538	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		0.9	□□□□□ -2.27
EP300-208	ENST00000635538	MT4	P47944	62 aa		0.89	□□□□□ -2.27
EP300-208	ENST00000635538	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		0.87	□□□□□ -2.27
EP300-208	ENST00000635538	MT1B	P07438	61 aa		0.85	□□□□□ -2.27
EP300-208	ENST00000635538	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		0.84	□□□□□ -2.27
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		0.82	□□□□□ -2.28
EP300-208	ENST00000635538	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EP300-208	ENST00000635538	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
EP300-208	ENST00000635538		M0QZ58	72 aa		0.79	□□□□□ -2.28
EP300-208	ENST00000635538	MT1X	P80297	61 aa		0.76	□□□□□ -2.29
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		0.76	□□□□□ -2.29
EP300-208	ENST00000635538	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	0.74	□□□□□ -2.29
EP300-208	ENST00000635538	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		0.73	□□□□□ -2.29
EP300-208	ENST00000635538	TNP1	P09430	55 aa		0.72	□□□□□ -2.29
EP300-208	ENST00000635538	MUC5AC	P98088	5654 aa		0.71	□□□□□ -2.3
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		0.69	□□□□□ -2.3
EP300-208	ENST00000635538	MT1E	P04732	61 aa		0.68	□□□□□ -2.3
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		0.68	□□□□□ -2.3
EP300-208	ENST00000635538	MT1G	P13640	62 aa		0.67	□□□□□ -2.3
EP300-208	ENST00000635538	MT1M	Q8N339	61 aa		0.67	□□□□□ -2.3
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		0.66	□□□□□ -2.3
EP300-208	ENST00000635538	PRM1	P04553	51 aa		0.64	□□□□□ -2.31
EP300-208	ENST00000635538	MT1L	Q93083	61 aa		0.63	□□□□□ -2.31
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		0.6	□□□□□ -2.31
EP300-208	ENST00000635538	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		0.59	□□□□□ -2.31
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		0.58	□□□□□ -2.32
EP300-208	ENST00000635538	PHGR1	C9JFL3	82 aa		0.54	□□□□□ -2.32
EP300-208	ENST00000635538	MT1A	P04731	61 aa		0.51	□□□□□ -2.33

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 267.3 ms