RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-212ENST00000591041 SPRR2EP22531 72 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-212ENST00000591041 SPRR2BP35325 72 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-212ENST00000591041 SPRR2AP35326 72 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-212ENST00000591041 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-212ENST00000591041 MT1EP04732 61 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-212ENST00000591041 LUZP6Q538Z0 58 aa8.05□□□□□ -1.12
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.04□□□□□ -1.12
CAPNS1-212ENST00000591041 SPRR2DP22532 72 aa8.03□□□□□ -1.12
CAPNS1-212ENST00000591041 MT1LQ93083 61 aa8.03□□□□□ -1.12
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-212ENST00000591041 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-212ENST00000591041 MT1GP13640 62 aa7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE3BQ5TA77 95 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-212ENST00000591041 MT1MQ8N339 61 aa7.73□□□□□ -1.17
CAPNS1-212ENST00000591041 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFAF8A1L188 74 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE1DQ5T752 114 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-212ENST00000591041 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-212ENST00000591041 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.09□□□□□ -1.28
CAPNS1-212ENST00000591041 MT4P47944 62 aa7.08□□□□□ -1.28
CAPNS1-212ENST00000591041 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE4AQ5TA78 99 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0A0MQY5 61 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-212ENST00000591041 MT1AP04731 61 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP12-4P60329 112 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BS24 57 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 INE1O15225 51 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 MT3P25713 68 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC5ACP98088 5654 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP5-8O75690 187 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE1EQ5T753 118 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE1CQ5T751 118 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 PRM1P04553 51 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.37□□□□□ -1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE1FQ5T754 118 aa4.18□□□□□ -1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 PHGR1C9JFL3 82 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.46□□□□□ -2.02
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