RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 NEBP20929 6669 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0D9SG42 100 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-214ENST00000583153 MT1XP80297 61 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP12-1P59990 96 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-214ENST00000583153 MDN1Q9NU22 5596 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP12-2P59991 146 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-214ENST00000583153 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFAF8A1L188 74 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-214ENST00000583153 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-214ENST00000583153 SPRR2EP22531 72 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-214ENST00000583153 SPRR2BP35325 72 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-214ENST00000583153 SPRR2AP35326 72 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-214ENST00000583153 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP10-12P60413 245 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-214ENST00000583153 PP632Q6XCG6 107 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-214ENST00000583153 SPRR2DP22532 72 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-214ENST00000583153 LCE1EQ5T753 118 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-214ENST00000583153 LUZP6Q538Z0 58 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0A0MQY5 61 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-214ENST00000583153 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-214ENST00000583153 MT1EP04732 61 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-214ENST00000583153 TNP1P09430 55 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-214ENST00000583153 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-214ENST00000583153 MT1GP13640 62 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-214ENST00000583153 LCE3AQ5TA76 89 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-214ENST00000583153 MT1LQ93083 61 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-214ENST00000583153 MT1MQ8N339 61 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-214ENST00000583153 INE1O15225 51 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP12-3P60328 96 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-214ENST00000583153 MT3P25713 68 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-214ENST00000583153 MT4P47944 62 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-214ENST00000583153 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.84□□□□□ -1.96
PTPRM-214ENST00000583153 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-214ENST00000583153 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-214ENST00000583153 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP12-4P60329 112 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-214ENST00000583153 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-214ENST00000583153 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PTPRM-214ENST00000583153 LCE1FQ5T754 118 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-214ENST00000583153 MT1AP04731 61 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP5-8O75690 187 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-214ENST00000583153 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-214ENST00000583153 MUC5ACP98088 5654 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-214ENST00000583153 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-214ENST00000583153 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-214ENST00000583153 LCE1CQ5T751 118 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRM-214ENST00000583153 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRM-214ENST00000583153 LCE3DQ9BYE3 92 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-214ENST00000583153 PRM1P04553 51 aa1.93□□□□□ -2.1
PTPRM-214ENST00000583153 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.78□□□□□ -2.12
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.63□□□□□ -2.15
PTPRM-214ENST00000583153 PHGR1C9JFL3 82 aa1.56□□□□□ -2.16
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.32□□□□□ -2.2
PTPRM-214ENST00000583153 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.02□□□□□ -2.25
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