RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 DNAH9Q9NYC9 4486 aa1.05□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 DNAH6Q9C0G6 4158 aa1.04□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 SSPOA2VEC9 5147 aa1.04□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 STARD9Q9P2P6 4700 aa1.04□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 PKD1P98161 4303 aa1.04□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 M0R2T5 61 aa1.04□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.04□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.04□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.04□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 HMCN2Q8NDA2 5059 aa1.04□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa1.03□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa1.02□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 DNAH17Q9UFH2 4485 aa1.02□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 HSPG2P98160 4391 aa1.01□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP12-3P60328 96 aa1.01□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.01□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa1.01□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 APOBP04114 4563 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 FAT3Q8TDW7 4589 aa1□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 PKHD1P08F94 4074 aa1□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 DNAH5Q8TE73 4624 aa0.96□□□□□ -2.25
PTPRM-204ENST00000577468 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.95□□□□□ -2.26
PTPRM-204ENST00000577468 FAT2Q9NYQ8 4349 aa0.94□□□□□ -2.26
PTPRM-204ENST00000577468 MT1HL1P0DM35 61 aa0.94□□□□□ -2.26
PTPRM-204ENST00000577468 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
PTPRM-204ENST00000577468 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
PTPRM-204ENST00000577468 LRP2P98164 4655 aa0.91□□□□□ -2.26
PTPRM-204ENST00000577468 TNXBP22105 4242 aa0.91□□□□□ -2.26
PTPRM-204ENST00000577468 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.9□□□□□ -2.27
PTPRM-204ENST00000577468 KMT2DO14686 5537 aa0.9□□□□□ -2.27
PTPRM-204ENST00000577468 FAT1Q14517 4588 aa0.89□□□□□ -2.27
PTPRM-204ENST00000577468 USH2AO75445 5202 aa0.89□□□□□ -2.27
PTPRM-204ENST00000577468 PRM1P04553 51 aa0.89□□□□□ -2.27
PTPRM-204ENST00000577468 LPAP08519 4548 aa0.88□□□□□ -2.27
PTPRM-204ENST00000577468 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.86□□□□□ -2.27
PTPRM-204ENST00000577468 MUC12Q9UKN1 5478 aa0.85□□□□□ -2.27
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PTPRM-204ENST00000577468 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.28
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PTPRM-204ENST00000577468 MT1HP80294 61 aa0.83□□□□□ -2.28
PTPRM-204ENST00000577468 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
PTPRM-204ENST00000577468 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.81□□□□□ -2.28
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.8□□□□□ -2.28
PTPRM-204ENST00000577468 MDN1Q9NU22 5596 aa0.78□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa0.77□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 MUC5ACP98088 5654 aa0.76□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 MT1EP04732 61 aa0.75□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.75□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 MT2AP02795 61 aa0.74□□□□□ -2.29
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PTPRM-204ENST00000577468 SPRR2BP35325 72 aa0.74□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 SPRR2DP22532 72 aa0.73□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 SPRR2AP35326 72 aa0.73□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa0.73□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 MT1LQ93083 61 aa0.73□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa0.72□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.72□□□□□ -2.29
PTPRM-204ENST00000577468 SPRR2EP22531 72 aa0.71□□□□□ -2.3
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.71□□□□□ -2.3
PTPRM-204ENST00000577468 MT1XP80297 61 aa0.7□□□□□ -2.3
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRM-204ENST00000577468 MT1BP07438 61 aa0.64□□□□□ -2.31
PTPRM-204ENST00000577468 MT4P47944 62 aa0.63□□□□□ -2.31
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.62□□□□□ -2.31
PTPRM-204ENST00000577468 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.57□□□□□ -2.32
PTPRM-204ENST00000577468 MT1GP13640 62 aa0.56□□□□□ -2.32
PTPRM-204ENST00000577468 MT1MQ8N339 61 aa0.55□□□□□ -2.32
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa0.51□□□□□ -2.33
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.51□□□□□ -2.33
PTPRM-204ENST00000577468 PHGR1C9JFL3 82 aa0.5□□□□□ -2.33
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