RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		6.31	□□□□□ -1.4
TBCD-223	ENST00000576691	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TBCD-223	ENST00000576691	PP632	Q6XCG6	107 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TBCD-223	ENST00000576691	SPRR2D	P22532	72 aa		6.19	□□□□□ -1.42
TBCD-223	ENST00000576691	MT1E	P04732	61 aa		6.18	□□□□□ -1.42
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TBCD-223	ENST00000576691	LCE3B	Q5TA77	95 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TBCD-223	ENST00000576691	MT1L	Q93083	61 aa		6	□□□□□ -1.45
TBCD-223	ENST00000576691	MT1G	P13640	62 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TBCD-223	ENST00000576691	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TBCD-223	ENST00000576691	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TBCD-223	ENST00000576691	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TBCD-223	ENST00000576691	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TBCD-223	ENST00000576691	MT1M	Q8N339	61 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TBCD-223	ENST00000576691	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TBCD-223	ENST00000576691	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TBCD-223	ENST00000576691	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.58	□□□□□ -1.52
TBCD-223	ENST00000576691	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.55	□□□□□ -1.52
TBCD-223	ENST00000576691	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TBCD-223	ENST00000576691	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TBCD-223	ENST00000576691	MT4	P47944	62 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TBCD-223	ENST00000576691	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TBCD-223	ENST00000576691	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
TBCD-223	ENST00000576691	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TBCD-223	ENST00000576691	MT1A	P04731	61 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TBCD-223	ENST00000576691	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TBCD-223	ENST00000576691	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TBCD-223	ENST00000576691	MT3	P25713	68 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TBCD-223	ENST00000576691	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TBCD-223	ENST00000576691	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TBCD-223	ENST00000576691	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TBCD-223	ENST00000576691	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCD-223	ENST00000576691	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCD-223	ENST00000576691	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TBCD-223	ENST00000576691	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TBCD-223	ENST00000576691	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TBCD-223	ENST00000576691		A0A0A0MQY5	61 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TBCD-223	ENST00000576691	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TBCD-223	ENST00000576691	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TBCD-223	ENST00000576691	INE1	O15225	51 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TBCD-223	ENST00000576691		H3BS24	57 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TBCD-223	ENST00000576691	PRM1	P04553	51 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TBCD-223	ENST00000576691	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TBCD-223	ENST00000576691	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TBCD-223	ENST00000576691	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.42	□□□□□ -2.02
TBCD-223	ENST00000576691	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.91	□□□□□ -2.1

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