RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.75□□□□□ -1.49
CTU2-209ENST00000567316 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.74□□□□□ -1.49
CTU2-209ENST00000567316 PP632Q6XCG6 107 aa5.7□□□□□ -1.5
CTU2-209ENST00000567316 MT1EP04732 61 aa5.67□□□□□ -1.5
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP12-3P60328 96 aa5.65□□□□□ -1.5
CTU2-209ENST00000567316 SPRR2DP22532 72 aa5.62□□□□□ -1.51
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.61□□□□□ -1.51
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.61□□□□□ -1.51
CTU2-209ENST00000567316 PRAC1Q96KF2 57 aa5.59□□□□□ -1.51
CTU2-209ENST00000567316 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.56□□□□□ -1.52
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.52□□□□□ -1.53
CTU2-209ENST00000567316 MT1LQ93083 61 aa5.52□□□□□ -1.53
CTU2-209ENST00000567316 LCE3BQ5TA77 95 aa5.47□□□□□ -1.53
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.46□□□□□ -1.54
CTU2-209ENST00000567316 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.45□□□□□ -1.54
CTU2-209ENST00000567316 MT1GP13640 62 aa5.44□□□□□ -1.54
CTU2-209ENST00000567316 MT1MQ8N339 61 aa5.37□□□□□ -1.55
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.33□□□□□ -1.56
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.3□□□□□ -1.56
CTU2-209ENST00000567316 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.27□□□□□ -1.57
CTU2-209ENST00000567316 SVIPQ8NHG7 77 aa5.24□□□□□ -1.57
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.24□□□□□ -1.57
CTU2-209ENST00000567316 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.14□□□□□ -1.59
CTU2-209ENST00000567316 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.99□□□□□ -1.61
CTU2-209ENST00000567316 LCE1DQ5T752 114 aa4.99□□□□□ -1.61
CTU2-209ENST00000567316 LCE4AQ5TA78 99 aa4.98□□□□□ -1.61
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.97□□□□□ -1.61
CTU2-209ENST00000567316 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.96□□□□□ -1.62
CTU2-209ENST00000567316 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.95□□□□□ -1.62
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.94□□□□□ -1.62
CTU2-209ENST00000567316 MT4P47944 62 aa4.93□□□□□ -1.62
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CTU2-209ENST00000567316 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.82□□□□□ -1.64
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CTU2-209ENST00000567316 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.71□□□□□ -1.65
CTU2-209ENST00000567316 MT1AP04731 61 aa4.7□□□□□ -1.66
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.69□□□□□ -1.66
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.65□□□□□ -1.67
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP12-4P60329 112 aa4.61□□□□□ -1.67
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.61□□□□□ -1.67
CTU2-209ENST00000567316 LUZP6Q538Z0 58 aa4.58□□□□□ -1.68
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.56□□□□□ -1.68
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.52□□□□□ -1.69
CTU2-209ENST00000567316 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.5□□□□□ -1.69
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.35□□□□□ -1.71
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.33□□□□□ -1.72
CTU2-209ENST00000567316 MT3P25713 68 aa4.26□□□□□ -1.73
CTU2-209ENST00000567316 NDUFAF8A1L188 74 aa4.24□□□□□ -1.73
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.19□□□□□ -1.74
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP5-8O75690 187 aa4.05□□□□□ -1.76
CTU2-209ENST00000567316 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.9□□□□□ -1.79
CTU2-209ENST00000567316 MUC5ACP98088 5654 aa3.89□□□□□ -1.79
CTU2-209ENST00000567316 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.89□□□□□ -1.79
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.88□□□□□ -1.79
CTU2-209ENST00000567316 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CTU2-209ENST00000567316 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.86□□□□□ -1.79
CTU2-209ENST00000567316 LCE1EQ5T753 118 aa3.78□□□□□ -1.8
CTU2-209ENST00000567316 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.76□□□□□ -1.81
CTU2-209ENST00000567316 A0A0A0MQY5 61 aa3.63□□□□□ -1.83
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.54□□□□□ -1.84
CTU2-209ENST00000567316 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.53□□□□□ -1.84
CTU2-209ENST00000567316 LCE1CQ5T751 118 aa3.51□□□□□ -1.85
CTU2-209ENST00000567316 INE1O15225 51 aa3.5□□□□□ -1.85
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.16□□□□□ -1.9
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.15□□□□□ -1.91
CTU2-209ENST00000567316 H3BS24 57 aa3.13□□□□□ -1.91
CTU2-209ENST00000567316 PRM1P04553 51 aa3.13□□□□□ -1.91
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.05□□□□□ -1.92
CTU2-209ENST00000567316 LCE1FQ5T754 118 aa3.05□□□□□ -1.92
CTU2-209ENST00000567316 PHGR1C9JFL3 82 aa2.77□□□□□ -1.97
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.73□□□□□ -1.97
CTU2-209ENST00000567316 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.38□□□□□ -2.03
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.08□□□□□ -2.08
CTU2-209ENST00000567316 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.71□□□□□ -2.14
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