RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-1.38□□□□□ -2.63
FAM227B-211ENST00000560557 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-1.38□□□□□ -2.63
FAM227B-211ENST00000560557 BRCA2P51587 3418 aa-1.39□□□□□ -2.63
FAM227B-211ENST00000560557 LMO7Q8WWI1 1683 aa-1.39□□□□□ -2.63
FAM227B-211ENST00000560557 SYCP2Q9BX26 1530 aa-1.4□□□□□ -2.63
FAM227B-211ENST00000560557 CDH23Q9H251 3354 aa-1.4□□□□□ -2.63
FAM227B-211ENST00000560557 SCRIBQ14160 1630 aa-1.41□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-1.41□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 TFF3Q07654 80 aa-1.42□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-1.42□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM2Q9BVW6 85 aa-1.42□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-1.42□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 VPS13AQ96RL7 3174 aa-1.43□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-1.43□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-1.43□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 PLNP26678 52 aa-1.43□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 XIRP2A4UGR9 3374 aa-1.43□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 AGLP35573 1532 aa-1.44□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 PDCD5O14737 125 aa-1.45□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB133Q30KQ1 61 aa-1.46□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-1.46□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 CLTCL1P53675 1640 aa-1.47□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-1.47□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 CPS1P31327 1500 aa-1.47□□□□□ -2.64
FAM227B-211ENST00000560557 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
FAM227B-211ENST00000560557 CD52P31358 61 aa-1.49□□□□□ -2.65
FAM227B-211ENST00000560557 TRPM2O94759 1503 aa-1.5□□□□□ -2.65
FAM227B-211ENST00000560557 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-1.5□□□□□ -2.65
FAM227B-211ENST00000560557 UTRNP46939 3433 aa-1.5□□□□□ -2.65
FAM227B-211ENST00000560557 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-1.51□□□□□ -2.65
FAM227B-211ENST00000560557 HTN1P15515 57 aa-1.52□□□□□ -2.65
FAM227B-211ENST00000560557 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-1.52□□□□□ -2.65
FAM227B-211ENST00000560557 TOMM7Q9P0U1 55 aa-1.52□□□□□ -2.65
FAM227B-211ENST00000560557 EFCAB5A4FU69 1503 aa-1.52□□□□□ -2.65
FAM227B-211ENST00000560557 A0A087WWC5 75 aa-1.55□□□□□ -2.66
FAM227B-211ENST00000560557 A0A096LNI7 61 aa-1.55□□□□□ -2.66
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFA1O15239 70 aa-1.56□□□□□ -2.66
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM5Q71RC9 77 aa-1.56□□□□□ -2.66
FAM227B-211ENST00000560557 IQGAP1P46940 1657 aa-1.56□□□□□ -2.66
FAM227B-211ENST00000560557 PRXQ9BXM0 1461 aa-1.57□□□□□ -2.66
FAM227B-211ENST00000560557 NFAT5O94916 1531 aa-1.58□□□□□ -2.66
FAM227B-211ENST00000560557 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
FAM227B-211ENST00000560557 ADCY10Q96PN6 1610 aa-1.61□□□□□ -2.67
FAM227B-211ENST00000560557 CMC2Q9NRP2 79 aa-1.61□□□□□ -2.67
FAM227B-211ENST00000560557 ABCC8Q09428 1581 aa-1.61□□□□□ -2.67
FAM227B-211ENST00000560557 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-1.63□□□□□ -2.67
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB124Q8NES8 71 aa-1.64□□□□□ -2.67
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-1.64□□□□□ -2.67
FAM227B-211ENST00000560557 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-1.68□□□□□ -2.68
FAM227B-211ENST00000560557 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-1.68□□□□□ -2.68
FAM227B-211ENST00000560557 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-1.71□□□□□ -2.68
FAM227B-211ENST00000560557 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-1.72□□□□□ -2.69
FAM227B-211ENST00000560557 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-1.72□□□□□ -2.69
FAM227B-211ENST00000560557 LINC01556Q5JQF7 62 aa-1.74□□□□□ -2.69
FAM227B-211ENST00000560557 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
FAM227B-211ENST00000560557 ATP7AQ04656 1500 aa-1.79□□□□□ -2.7
FAM227B-211ENST00000560557 H3BUX3 64 aa-1.79□□□□□ -2.7
FAM227B-211ENST00000560557 MROH2BQ7Z745 1585 aa-1.81□□□□□ -2.7
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-1.85□□□□□ -2.71
FAM227B-211ENST00000560557 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-1.86□□□□□ -2.71
FAM227B-211ENST00000560557 APELAP0DMC3 54 aa-1.92□□□□□ -2.72
FAM227B-211ENST00000560557 IQGAP2Q13576 1575 aa-1.93□□□□□ -2.72
FAM227B-211ENST00000560557 K7EIM0 57 aa-1.94□□□□□ -2.72
FAM227B-211ENST00000560557 A0A096LPF7 62 aa-1.95□□□□□ -2.72
FAM227B-211ENST00000560557 TOMM5Q8N4H5 51 aa-1.95□□□□□ -2.72
FAM227B-211ENST00000560557 PRCDQ00LT1 54 aa-1.99□□□□□ -2.73
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-1.99□□□□□ -2.73
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-2.02□□□□□ -2.73
FAM227B-211ENST00000560557 HTN3P15516 51 aa-2.03□□□□□ -2.73
FAM227B-211ENST00000560557 Q9Y3F1 56 aa-2.11□□□□□ -2.75
FAM227B-211ENST00000560557 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
FAM227B-211ENST00000560557 H3BSH0 61 aa-2.16□□□□□ -2.76
FAM227B-211ENST00000560557 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-2.18□□□□□ -2.76
FAM227B-211ENST00000560557 RPL39P5Q59GN2 51 aa-2.21□□□□□ -2.76
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB108AA8MXU0 73 aa-2.23□□□□□ -2.77
FAM227B-211ENST00000560557 COX14Q96I36 57 aa-2.26□□□□□ -2.77
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB108BQ8NET1 73 aa-2.35□□□□□ -2.79
FAM227B-211ENST00000560557 STATHP02808 62 aa-2.38□□□□□ -2.79
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms