RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 MT1EP04732 61 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPRR2EP22531 72 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPRR2BP35325 72 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPRR2AP35326 72 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 PMAIP1Q13794 54 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 NEBP20929 6669 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRO0628Q9UI54 55 aa6.81□□□□□ -1.32
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USP3-AS1-203ENST00000559737 PP632Q6XCG6 107 aa6.73□□□□□ -1.33
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USP3-AS1-203ENST00000559737 MT1LQ93083 61 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-AS1-203ENST00000559737 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPRR2DP22532 72 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-203ENST00000559737 MT1GP13640 62 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.46□□□□□ -1.38
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.43□□□□□ -1.38
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.43□□□□□ -1.38
USP3-AS1-203ENST00000559737 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.4□□□□□ -1.39
USP3-AS1-203ENST00000559737 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-203ENST00000559737 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.26□□□□□ -1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.26□□□□□ -1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.18□□□□□ -1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 SVIPQ8NHG7 77 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 H3BS24 57 aa6□□□□□ -1.45
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.98□□□□□ -1.45
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.79□□□□□ -1.48
USP3-AS1-203ENST00000559737 MT4P47944 62 aa5.76□□□□□ -1.49
USP3-AS1-203ENST00000559737 MT1AP04731 61 aa5.67□□□□□ -1.5
USP3-AS1-203ENST00000559737 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.64□□□□□ -1.51
USP3-AS1-203ENST00000559737 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.62□□□□□ -1.51
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP12-4P60329 112 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-203ENST00000559737 LUZP6Q538Z0 58 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.27□□□□□ -1.57
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.24□□□□□ -1.57
USP3-AS1-203ENST00000559737 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-203ENST00000559737 MT3P25713 68 aa5.15□□□□□ -1.58
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.06□□□□□ -1.6
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.04□□□□□ -1.6
USP3-AS1-203ENST00000559737 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-203ENST00000559737 NDUFAF8A1L188 74 aa4.88□□□□□ -1.63
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USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP5-8O75690 187 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.65□□□□□ -1.66
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USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.62□□□□□ -1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 LCE1EQ5T753 118 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-203ENST00000559737 MUC5ACP98088 5654 aa4.48□□□□□ -1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.46□□□□□ -1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.32□□□□□ -1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 LCE1CQ5T751 118 aa4.26□□□□□ -1.73
USP3-AS1-203ENST00000559737 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A0A0MQY5 61 aa4.13□□□□□ -1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 INE1O15225 51 aa3.95□□□□□ -1.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.79□□□□□ -1.8
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.7□□□□□ -1.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRM1P04553 51 aa3.69□□□□□ -1.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 LCE1FQ5T754 118 aa3.54□□□□□ -1.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 PHGR1C9JFL3 82 aa3.28□□□□□ -1.88
USP3-AS1-203ENST00000559737 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.98□□□□□ -1.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.17□□□□□ -2.06
USP3-AS1-203ENST00000559737 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.1□□□□□ -2.07
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