RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554900.1

RPS6KL1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, human

TSL 5

Gene RPS6KL1, Length 445 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.53	□□□□□ -1.52
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.52	□□□□□ -1.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MT1E	P04732	61 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPS6KL1-208	ENST00000554900	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MT1G	P13640	62 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MT1L	Q93083	61 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MT1M	Q8N339	61 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MT4	P47944	62 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS6KL1-208	ENST00000554900	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS6KL1-208	ENST00000554900	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MT1A	P04731	61 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MT3	P25713	68 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS6KL1-208	ENST00000554900	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPS6KL1-208	ENST00000554900	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS6KL1-208	ENST00000554900		A0A0A0MQY5	61 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS6KL1-208	ENST00000554900		H3BS24	57 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS6KL1-208	ENST00000554900	INE1	O15225	51 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PRM1	P04553	51 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.52	□□□□□ -2.01
RPS6KL1-208	ENST00000554900	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.21	□□□□□ -2.06
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.81	□□□□□ -2.12

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