RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538860.1

ADD1-223, Transcript of adducin 1, human

TSL 3

Gene ADD1, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-223	ENST00000538860	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.64	□□□□□ -1.51
ADD1-223	ENST00000538860	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.64	□□□□□ -1.51
ADD1-223	ENST00000538860	TNP1	P09430	55 aa		5.61	□□□□□ -1.51
ADD1-223	ENST00000538860	SPRR2D	P22532	72 aa		5.59	□□□□□ -1.51
ADD1-223	ENST00000538860		K7ERS5	55 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ADD1-223	ENST00000538860		A6NED7	52 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ADD1-223	ENST00000538860	MT1E	P04732	61 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ADD1-223	ENST00000538860	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ADD1-223	ENST00000538860	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ADD1-223	ENST00000538860	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ADD1-223	ENST00000538860	MT1G	P13640	62 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ADD1-223	ENST00000538860	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ADD1-223	ENST00000538860	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.31	□□□□□ -1.56
ADD1-223	ENST00000538860	MT1L	Q93083	61 aa		5.3	□□□□□ -1.56
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ADD1-223	ENST00000538860	ROMO1	P60602	79 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ADD1-223	ENST00000538860	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ADD1-223	ENST00000538860	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ADD1-223	ENST00000538860	MT1M	Q8N339	61 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ADD1-223	ENST00000538860	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ADD1-223	ENST00000538860	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ADD1-223	ENST00000538860	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ADD1-223	ENST00000538860	MT4	P47944	62 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ADD1-223	ENST00000538860	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ADD1-223	ENST00000538860	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ADD1-223	ENST00000538860	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ADD1-223	ENST00000538860		H3BS24	57 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ADD1-223	ENST00000538860	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ADD1-223	ENST00000538860	MT1A	P04731	61 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ADD1-223	ENST00000538860	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ADD1-223	ENST00000538860	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ADD1-223	ENST00000538860		A0A0A0MQY5	61 aa		4.42	□□□□□ -1.7
ADD1-223	ENST00000538860	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ADD1-223	ENST00000538860	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ADD1-223	ENST00000538860	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.33	□□□□□ -1.72
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ADD1-223	ENST00000538860	MT3	P25713	68 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ADD1-223	ENST00000538860	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
ADD1-223	ENST00000538860	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ADD1-223	ENST00000538860	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ADD1-223	ENST00000538860	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ADD1-223	ENST00000538860	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ADD1-223	ENST00000538860	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ADD1-223	ENST00000538860	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ADD1-223	ENST00000538860	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.25	□□□□□ -1.89
ADD1-223	ENST00000538860	INE1	O15225	51 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ADD1-223	ENST00000538860	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ADD1-223	ENST00000538860	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ADD1-223	ENST00000538860	PRM1	P04553	51 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ADD1-223	ENST00000538860	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.48	□□□□□ -2.01
ADD1-223	ENST00000538860	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ADD1-223	ENST00000538860	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.75	□□□□□ -2.13

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 5.7 ms