RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSRP1-213	ENST00000530120	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSRP1-213	ENST00000530120	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CSRP1-213	ENST00000530120	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CSRP1-213	ENST00000530120	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSRP1-213	ENST00000530120	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSRP1-213	ENST00000530120	TNP1	P09430	55 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSRP1-213	ENST00000530120	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSRP1-213	ENST00000530120	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSRP1-213	ENST00000530120		H3BS24	57 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CSRP1-213	ENST00000530120	MT4	P47944	62 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CSRP1-213	ENST00000530120	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSRP1-213	ENST00000530120	MT1E	P04732	61 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CSRP1-213	ENST00000530120	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CSRP1-213	ENST00000530120	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CSRP1-213	ENST00000530120	MT1G	P13640	62 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSRP1-213	ENST00000530120	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.33	□□□□□ -1.72
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.32	□□□□□ -1.72
CSRP1-213	ENST00000530120	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CSRP1-213	ENST00000530120	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSRP1-213	ENST00000530120	MT1M	Q8N339	61 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSRP1-213	ENST00000530120	MT1L	Q93083	61 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSRP1-213	ENST00000530120		A0A0A0MQY5	61 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CSRP1-213	ENST00000530120	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CSRP1-213	ENST00000530120	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CSRP1-213	ENST00000530120	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CSRP1-213	ENST00000530120	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CSRP1-213	ENST00000530120	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CSRP1-213	ENST00000530120	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSRP1-213	ENST00000530120	INE1	O15225	51 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CSRP1-213	ENST00000530120	MT1A	P04731	61 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSRP1-213	ENST00000530120	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CSRP1-213	ENST00000530120	MT3	P25713	68 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CSRP1-213	ENST00000530120	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSRP1-213	ENST00000530120	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSRP1-213	ENST00000530120	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSRP1-213	ENST00000530120	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.93	□□□□□ -1.94
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.91	□□□□□ -1.94
CSRP1-213	ENST00000530120	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.9	□□□□□ -1.95
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.85	□□□□□ -1.95
CSRP1-213	ENST00000530120	PRM1	P04553	51 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSRP1-213	ENST00000530120	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSRP1-213	ENST00000530120	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.37	□□□□□ -2.03
CSRP1-213	ENST00000530120	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.22	□□□□□ -2.05
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.2	□□□□□ -2.06
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.03	□□□□□ -2.08
CSRP1-213	ENST00000530120	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.58	□□□□□ -2.16

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