RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513423.1

FGFR4-215, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, human

TSL 2

Gene FGFR4, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGFR4-215	ENST00000513423	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGFR4-215	ENST00000513423	MT1G	P13640	62 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGFR4-215	ENST00000513423	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGFR4-215	ENST00000513423	MT1L	Q93083	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FGFR4-215	ENST00000513423	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGFR4-215	ENST00000513423	MT1M	Q8N339	61 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGFR4-215	ENST00000513423	ROMO1	P60602	79 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGFR4-215	ENST00000513423	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FGFR4-215	ENST00000513423	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FGFR4-215	ENST00000513423	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.48	□□□□□ -1.69
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.48	□□□□□ -1.69
FGFR4-215	ENST00000513423	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.47	□□□□□ -1.69
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.46	□□□□□ -1.7
FGFR4-215	ENST00000513423	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FGFR4-215	ENST00000513423	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.38	□□□□□ -1.71
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
FGFR4-215	ENST00000513423	MT4	P47944	62 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FGFR4-215	ENST00000513423	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.31	□□□□□ -1.72
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.3	□□□□□ -1.72
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.24	□□□□□ -1.73
FGFR4-215	ENST00000513423	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FGFR4-215	ENST00000513423	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FGFR4-215	ENST00000513423	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FGFR4-215	ENST00000513423	MT1A	P04731	61 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FGFR4-215	ENST00000513423	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FGFR4-215	ENST00000513423	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FGFR4-215	ENST00000513423	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4	□□□□□ -1.77
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FGFR4-215	ENST00000513423	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.94	□□□□□ -1.78
FGFR4-215	ENST00000513423	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.94	□□□□□ -1.78
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.8	□□□□□ -1.8
FGFR4-215	ENST00000513423	MT3	P25713	68 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FGFR4-215	ENST00000513423	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.71	□□□□□ -1.82
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.63	□□□□□ -1.83
FGFR4-215	ENST00000513423	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.62	□□□□□ -1.83
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.5	□□□□□ -1.85
FGFR4-215	ENST00000513423	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FGFR4-215	ENST00000513423	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FGFR4-215	ENST00000513423	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.26	□□□□□ -1.89
FGFR4-215	ENST00000513423	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.25	□□□□□ -1.89
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.22	□□□□□ -1.89
FGFR4-215	ENST00000513423	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FGFR4-215	ENST00000513423	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
FGFR4-215	ENST00000513423	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FGFR4-215	ENST00000513423	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FGFR4-215	ENST00000513423	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FGFR4-215	ENST00000513423	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.94	□□□□□ -1.94
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.85	□□□□□ -1.95
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.82	□□□□□ -1.96
FGFR4-215	ENST00000513423	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FGFR4-215	ENST00000513423	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.46	□□□□□ -2.02
FGFR4-215	ENST00000513423	PRM1	P04553	51 aa		2.45	□□□□□ -2.02
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.44	□□□□□ -2.02
FGFR4-215	ENST00000513423	INE1	O15225	51 aa		2.41	□□□□□ -2.02
FGFR4-215	ENST00000513423		A0A0A0MQY5	61 aa		2.39	□□□□□ -2.03
FGFR4-215	ENST00000513423	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.19	□□□□□ -2.06
FGFR4-215	ENST00000513423	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.73	□□□□□ -2.13
FGFR4-215	ENST00000513423	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.55	□□□□□ -2.16
FGFR4-215	ENST00000513423		H3BS24	57 aa		1.54	□□□□□ -2.16

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