RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 USP34Q70CQ2 3546 aa-0.06□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.06□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.06□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 PCNTO95613 3336 aa-0.07□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-0.07□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 MT4P47944 62 aa-0.07□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 SPEGQ15772 3267 aa-0.07□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 CEP350Q5VT06 3117 aa-0.08□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-0.08□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 CLTCL1P53675 1640 aa-0.08□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 DEFB1P60022 68 aa-0.09□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 MT1HP80294 61 aa-0.09□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 EP400Q96L91 3159 aa-0.1□□□□□ -2.42
HERC3-209ENST00000504994 UNC80Q8N2C7 3258 aa-0.1□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 ASPMQ8IZT6 3477 aa-0.1□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 MT1XP80297 61 aa-0.1□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-0.1□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 LOC400499M0QZD8 3231 aa-0.11□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 XIRP2A4UGR9 3374 aa-0.11□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 MT1EP04732 61 aa-0.11□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 MT1GP13640 62 aa-0.11□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 MT1LQ93083 61 aa-0.11□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-0.11□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 ATP7AQ04656 1500 aa-0.12□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 BRCA2P51587 3418 aa-0.12□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 VCANP13611 3396 aa-0.12□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 CDH23Q9H251 3354 aa-0.12□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 CENPFP49454 3210 aa-0.12□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 VPS13AQ96RL7 3174 aa-0.12□□□□□ -2.43
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HERC3-209ENST00000504994 MT2AP02795 61 aa-0.13□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.13□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 MT1MQ8N339 61 aa-0.13□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 LEAP2Q969E1 77 aa-0.13□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 DEFB136Q30KP8 78 aa-0.14□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 UTRNP46939 3433 aa-0.14□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 MT1BP07438 61 aa-0.15□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 TOMM7Q9P0U1 55 aa-0.15□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
HERC3-209ENST00000504994 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-0.16□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 MT1FP04733 61 aa-0.17□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.17□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 A0A096LNI7 61 aa-0.18□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-0.18□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-0.18□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-0.18□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 MROH2BQ7Z745 1585 aa-0.19□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 DEFB133Q30KQ1 61 aa-0.19□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.19□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 DEFB124Q8NES8 71 aa-0.19□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-0.19□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 HTN1P15515 57 aa-0.2□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 TTTY10Q9BZA0 68 aa-0.2□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 H3BUX3 64 aa-0.22□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 K7EIM0 57 aa-0.22□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 CD52P31358 61 aa-0.22□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 PRCDQ00LT1 54 aa-0.22□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-0.22□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-0.22□□□□□ -2.44
HERC3-209ENST00000504994 LINC01556Q5JQF7 62 aa-0.23□□□□□ -2.45
HERC3-209ENST00000504994 A0A096LPF7 62 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-209ENST00000504994 H3BSH0 61 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-209ENST00000504994 APELAP0DMC3 54 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-209ENST00000504994 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-209ENST00000504994 RPL39P5Q59GN2 51 aa-0.25□□□□□ -2.45
HERC3-209ENST00000504994 DEFB108AA8MXU0 73 aa-0.26□□□□□ -2.45
HERC3-209ENST00000504994 HTN3P15516 51 aa-0.27□□□□□ -2.45
HERC3-209ENST00000504994 DEFB108BQ8NET1 73 aa-0.3□□□□□ -2.46
HERC3-209ENST00000504994 Q9Y3F1 56 aa-0.3□□□□□ -2.46
HERC3-209ENST00000504994 COX14Q96I36 57 aa-0.31□□□□□ -2.46
HERC3-209ENST00000504994 STATHP02808 62 aa-0.32□□□□□ -2.46
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