RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.32□□□□□ -1.56
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP2-208ENST00000504294 PP632Q6XCG6 107 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP2-208ENST00000504294 ROMO1P60602 79 aa5.28□□□□□ -1.56
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.28□□□□□ -1.56
SH3BP2-208ENST00000504294 MT1GP13640 62 aa5.27□□□□□ -1.57
SH3BP2-208ENST00000504294 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.27□□□□□ -1.57
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP12-3P60328 96 aa5.24□□□□□ -1.57
SH3BP2-208ENST00000504294 LCE3BQ5TA77 95 aa5.21□□□□□ -1.58
SH3BP2-208ENST00000504294 MT1LQ93083 61 aa5.18□□□□□ -1.58
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.16□□□□□ -1.58
SH3BP2-208ENST00000504294 BRK1Q8WUW1 75 aa5.11□□□□□ -1.59
SH3BP2-208ENST00000504294 MT1MQ8N339 61 aa5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2-208ENST00000504294 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5□□□□□ -1.61
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.89□□□□□ -1.63
SH3BP2-208ENST00000504294 PMAIP1Q13794 54 aa4.86□□□□□ -1.63
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.86□□□□□ -1.63
SH3BP2-208ENST00000504294 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP2-208ENST00000504294 LCE4AQ5TA78 99 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP2-208ENST00000504294 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.75□□□□□ -1.65
SH3BP2-208ENST00000504294 PRO0628Q9UI54 55 aa4.73□□□□□ -1.65
SH3BP2-208ENST00000504294 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.73□□□□□ -1.65
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.72□□□□□ -1.65
SH3BP2-208ENST00000504294 LCE1DQ5T752 114 aa4.69□□□□□ -1.66
SH3BP2-208ENST00000504294 MT4P47944 62 aa4.64□□□□□ -1.67
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.59□□□□□ -1.67
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP12-4P60329 112 aa4.58□□□□□ -1.68
SH3BP2-208ENST00000504294 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.57□□□□□ -1.68
SH3BP2-208ENST00000504294 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.52□□□□□ -1.69
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.49□□□□□ -1.69
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.46□□□□□ -1.7
SH3BP2-208ENST00000504294 PRAC1Q96KF2 57 aa4.46□□□□□ -1.7
SH3BP2-208ENST00000504294 MT1AP04731 61 aa4.45□□□□□ -1.7
SH3BP2-208ENST00000504294 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.45□□□□□ -1.7
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.43□□□□□ -1.7
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.42□□□□□ -1.7
SH3BP2-208ENST00000504294 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.36□□□□□ -1.71
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.33□□□□□ -1.72
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.28□□□□□ -1.72
SH3BP2-208ENST00000504294 SVIPQ8NHG7 77 aa4.24□□□□□ -1.73
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.17□□□□□ -1.74
SH3BP2-208ENST00000504294 MT3P25713 68 aa4.11□□□□□ -1.75
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.11□□□□□ -1.75
SH3BP2-208ENST00000504294 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4□□□□□ -1.77
SH3BP2-208ENST00000504294 LUZP6Q538Z0 58 aa3.98□□□□□ -1.77
SH3BP2-208ENST00000504294 MUC5ACP98088 5654 aa3.97□□□□□ -1.77
SH3BP2-208ENST00000504294 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SH3BP2-208ENST00000504294 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.85□□□□□ -1.79
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP5-8O75690 187 aa3.82□□□□□ -1.8
SH3BP2-208ENST00000504294 LCE1EQ5T753 118 aa3.73□□□□□ -1.81
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.67□□□□□ -1.82
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.67□□□□□ -1.82
SH3BP2-208ENST00000504294 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.58□□□□□ -1.84
SH3BP2-208ENST00000504294 LCE1CQ5T751 118 aa3.44□□□□□ -1.86
SH3BP2-208ENST00000504294 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.44□□□□□ -1.86
SH3BP2-208ENST00000504294 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.42□□□□□ -1.86
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.37□□□□□ -1.87
SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFAF8A1L188 74 aa3.3□□□□□ -1.88
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.07□□□□□ -1.92
SH3BP2-208ENST00000504294 LCE1FQ5T754 118 aa3□□□□□ -1.93
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.94□□□□□ -1.94
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0A0MQY5 61 aa2.9□□□□□ -1.95
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.85□□□□□ -1.95
SH3BP2-208ENST00000504294 INE1O15225 51 aa2.83□□□□□ -1.96
SH3BP2-208ENST00000504294 PHGR1C9JFL3 82 aa2.72□□□□□ -1.97
SH3BP2-208ENST00000504294 PRM1P04553 51 aa2.65□□□□□ -1.99
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.51□□□□□ -2.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.33□□□□□ -2.04
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.04□□□□□ -2.08
SH3BP2-208ENST00000504294 H3BS24 57 aa1.86□□□□□ -2.11
SH3BP2-208ENST00000504294 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.72□□□□□ -2.13
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