RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498478.1

ITGB6-210, Transcript of integrin subunit beta 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB6, Length 705 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6-210ENST00000498478 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa0.62□□□□□ -2.31
ITGB6-210ENST00000498478 LINC00587B1AMM8 73 aa0.62□□□□□ -2.31
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ITGB6-210ENST00000498478 SPANXDQ9BXN6 97 aa0.62□□□□□ -2.31
ITGB6-210ENST00000498478 S100A8P05109 93 aa0.6□□□□□ -2.31
ITGB6-210ENST00000498478 Q9H521 79 aa0.6□□□□□ -2.31
ITGB6-210ENST00000498478 A0A1B0GV90 55 aa0.59□□□□□ -2.31
ITGB6-210ENST00000498478 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa0.59□□□□□ -2.31
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ITGB6-210ENST00000498478 LINC00643Q86TS7 51 aa-0.19□□□□□ -2.44
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