RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491084.5

KRTCAP2-208, Transcript of keratinocyte associated protein 2, human

TSL 3

Gene KRTCAP2, Length 598 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SPRR2D	P22532	72 aa		4.25	□□□□□ -1.73
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.25	□□□□□ -1.73
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.23	□□□□□ -1.73
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.23	□□□□□ -1.73
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.2	□□□□□ -1.74
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.13	□□□□□ -1.75
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4	□□□□□ -1.77
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MT1E	P04732	61 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.96	□□□□□ -1.78
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.93	□□□□□ -1.78
KRTCAP2-208	ENST00000491084	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.92	□□□□□ -1.78
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MT1G	P13640	62 aa		3.91	□□□□□ -1.78
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MT1M	Q8N339	61 aa		3.8	□□□□□ -1.8
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MT1L	Q93083	61 aa		3.8	□□□□□ -1.8
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.79	□□□□□ -1.8
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KRTCAP2-208	ENST00000491084	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.7	□□□□□ -1.82
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.7	□□□□□ -1.82
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MT4	P47944	62 aa		3.68	□□□□□ -1.82
KRTCAP2-208	ENST00000491084	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.66	□□□□□ -1.82
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.65	□□□□□ -1.83
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.63	□□□□□ -1.83
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.56	□□□□□ -1.84
KRTCAP2-208	ENST00000491084	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.54	□□□□□ -1.84
KRTCAP2-208	ENST00000491084		A0A0A0MQY5	61 aa		3.53	□□□□□ -1.84
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.53	□□□□□ -1.84
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.49	□□□□□ -1.85
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.48	□□□□□ -1.85
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.47	□□□□□ -1.85
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.45	□□□□□ -1.86
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.43	□□□□□ -1.86
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.41	□□□□□ -1.86
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.38	□□□□□ -1.87
KRTCAP2-208	ENST00000491084	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.29	□□□□□ -1.88
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.28	□□□□□ -1.88
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MT1A	P04731	61 aa		3.26	□□□□□ -1.89
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.16	□□□□□ -1.9
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.07	□□□□□ -1.92
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.04	□□□□□ -1.92
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MT3	P25713	68 aa		3.01	□□□□□ -1.93
KRTCAP2-208	ENST00000491084	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.98	□□□□□ -1.93
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.93	□□□□□ -1.94
KRTCAP2-208	ENST00000491084	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
KRTCAP2-208	ENST00000491084	INE1	O15225	51 aa		2.89	□□□□□ -1.95
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.85	□□□□□ -1.95
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.84	□□□□□ -1.95
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.79	□□□□□ -1.96
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.79	□□□□□ -1.96
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.71	□□□□□ -1.98
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.58	□□□□□ -2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.57	□□□□□ -2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.43	□□□□□ -2.02
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.33	□□□□□ -2.04
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.33	□□□□□ -2.04
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PRM1	P04553	51 aa		2.27	□□□□□ -2.05
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.11	□□□□□ -2.07
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.06	□□□□□ -2.08
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		1.89	□□□□□ -2.11
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.83	□□□□□ -2.12
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.59	□□□□□ -2.15
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.33	□□□□□ -2.2

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