RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP12-1P59990 96 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRN-217ENST00000489650 K7ERS5 55 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRN-217ENST00000489650 MT4P47944 62 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRN-217ENST00000489650 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRN-217ENST00000489650 MT1GP13640 62 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRN-217ENST00000489650 LCE4AQ5TA78 99 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRN-217ENST00000489650 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-217ENST00000489650 PP632Q6XCG6 107 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRN-217ENST00000489650 MT1MQ8N339 61 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRN-217ENST00000489650 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRN-217ENST00000489650 MT1LQ93083 61 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRN-217ENST00000489650 TNP1P09430 55 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRN-217ENST00000489650 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRN-217ENST00000489650 BRK1Q8WUW1 75 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRN-217ENST00000489650 LCE3AQ5TA76 89 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRN-217ENST00000489650 ROMO1P60602 79 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRN-217ENST00000489650 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP12-3P60328 96 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRN-217ENST00000489650 PMAIP1Q13794 54 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP12-4P60329 112 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRN-217ENST00000489650 PRO0628Q9UI54 55 aa6□□□□□ -1.45
PTPRN-217ENST00000489650 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRN-217ENST00000489650 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRN-217ENST00000489650 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRN-217ENST00000489650 PRAC1Q96KF2 57 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP5-8O75690 187 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRN-217ENST00000489650 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRN-217ENST00000489650 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRN-217ENST00000489650 MT1AP04731 61 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRN-217ENST00000489650 MUC5ACP98088 5654 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRN-217ENST00000489650 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRN-217ENST00000489650 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRN-217ENST00000489650 SVIPQ8NHG7 77 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRN-217ENST00000489650 MT3P25713 68 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRN-217ENST00000489650 LUZP6Q538Z0 58 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRN-217ENST00000489650 LCE1EQ5T753 118 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRN-217ENST00000489650 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRN-217ENST00000489650 LCE1CQ5T751 118 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRN-217ENST00000489650 NDUFAF8A1L188 74 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRN-217ENST00000489650 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRN-217ENST00000489650 LCE1FQ5T754 118 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRN-217ENST00000489650 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRN-217ENST00000489650 PHGR1C9JFL3 82 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRN-217ENST00000489650 A0A0A0MQY5 61 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRN-217ENST00000489650 INE1O15225 51 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRN-217ENST00000489650 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRN-217ENST00000489650 PRM1P04553 51 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRN-217ENST00000489650 H3BS24 57 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRN-217ENST00000489650 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.34□□□□□ -2.03
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