RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483418.1

NEB-212, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 3

Gene NEB, Length 643 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-212ENST00000483418 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-0.79□□□□□ -2.54
NEB-212ENST00000483418 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
NEB-212ENST00000483418 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-0.83□□□□□ -2.54
NEB-212ENST00000483418 ATMQ13315 3056 aa-0.84□□□□□ -2.54
NEB-212ENST00000483418 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.85□□□□□ -2.55
NEB-212ENST00000483418 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-0.86□□□□□ -2.55
NEB-212ENST00000483418 FREM2Q5SZK8 3169 aa-0.86□□□□□ -2.55
NEB-212ENST00000483418 TOMM7Q9P0U1 55 aa-0.86□□□□□ -2.55
NEB-212ENST00000483418 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-0.86□□□□□ -2.55
NEB-212ENST00000483418 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-0.87□□□□□ -2.55
NEB-212ENST00000483418 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
NEB-212ENST00000483418 CFAP54Q96N23 3096 aa-0.87□□□□□ -2.55
NEB-212ENST00000483418 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.88□□□□□ -2.55
NEB-212ENST00000483418 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
NEB-212ENST00000483418 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.89□□□□□ -2.55
NEB-212ENST00000483418 MT1FP04733 61 aa-0.91□□□□□ -2.56
NEB-212ENST00000483418 CEP250Q9BV73 2442 aa-0.93□□□□□ -2.56
NEB-212ENST00000483418 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-0.93□□□□□ -2.56
NEB-212ENST00000483418 PCNTO95613 3336 aa-0.94□□□□□ -2.56
NEB-212ENST00000483418 FRYLO94915 3013 aa-0.95□□□□□ -2.56
NEB-212ENST00000483418 VPS13CQ709C8 3753 aa-0.95□□□□□ -2.56
NEB-212ENST00000483418 SPEGQ15772 3267 aa-0.95□□□□□ -2.56
NEB-212ENST00000483418 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-0.97□□□□□ -2.56
NEB-212ENST00000483418 SZT2Q5T011 3432 aa-0.97□□□□□ -2.56
NEB-212ENST00000483418 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-0.98□□□□□ -2.57
NEB-212ENST00000483418 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-1.01□□□□□ -2.57
NEB-212ENST00000483418 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
NEB-212ENST00000483418 DEFB133Q30KQ1 61 aa-1.02□□□□□ -2.57
NEB-212ENST00000483418 CEP350Q5VT06 3117 aa-1.02□□□□□ -2.57
NEB-212ENST00000483418 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-1.02□□□□□ -2.57
NEB-212ENST00000483418 TTTY10Q9BZA0 68 aa-1.03□□□□□ -2.57
NEB-212ENST00000483418 EP400Q96L91 3159 aa-1.04□□□□□ -2.58
NEB-212ENST00000483418 DMDP11532 3685 aa-1.05□□□□□ -2.58
NEB-212ENST00000483418 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-1.05□□□□□ -2.58
NEB-212ENST00000483418 CENPEQ02224 2701 aa-1.06□□□□□ -2.58
NEB-212ENST00000483418 CD52P31358 61 aa-1.06□□□□□ -2.58
NEB-212ENST00000483418 MROH2BQ7Z745 1585 aa-1.07□□□□□ -2.58
NEB-212ENST00000483418 HTN1P15515 57 aa-1.07□□□□□ -2.58
NEB-212ENST00000483418 MUC3AQ02505 3323 aa-1.08□□□□□ -2.58
NEB-212ENST00000483418 A0A096LNI7 61 aa-1.09□□□□□ -2.58
NEB-212ENST00000483418 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-1.09□□□□□ -2.58
NEB-212ENST00000483418 DEFB124Q8NES8 71 aa-1.11□□□□□ -2.59
NEB-212ENST00000483418 XIRP2A4UGR9 3374 aa-1.11□□□□□ -2.59
NEB-212ENST00000483418 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-1.15□□□□□ -2.59
NEB-212ENST00000483418 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-1.15□□□□□ -2.59
NEB-212ENST00000483418 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-1.17□□□□□ -2.6
NEB-212ENST00000483418 USP34Q70CQ2 3546 aa-1.18□□□□□ -2.6
NEB-212ENST00000483418 LOC400499M0QZD8 3231 aa-1.18□□□□□ -2.6
NEB-212ENST00000483418 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-1.19□□□□□ -2.6
NEB-212ENST00000483418 H3BUX3 64 aa-1.2□□□□□ -2.6
NEB-212ENST00000483418 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-1.22□□□□□ -2.6
NEB-212ENST00000483418 ASPMQ8IZT6 3477 aa-1.23□□□□□ -2.61
NEB-212ENST00000483418 UNC80Q8N2C7 3258 aa-1.23□□□□□ -2.61
NEB-212ENST00000483418 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-1.23□□□□□ -2.61
NEB-212ENST00000483418 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-1.24□□□□□ -2.61
NEB-212ENST00000483418 BRCA2P51587 3418 aa-1.25□□□□□ -2.61
NEB-212ENST00000483418 LINC01556Q5JQF7 62 aa-1.27□□□□□ -2.61
NEB-212ENST00000483418 VCANP13611 3396 aa-1.28□□□□□ -2.61
NEB-212ENST00000483418 CENPFP49454 3210 aa-1.3□□□□□ -2.62
NEB-212ENST00000483418 K7EIM0 57 aa-1.3□□□□□ -2.62
NEB-212ENST00000483418 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-1.33□□□□□ -2.62
NEB-212ENST00000483418 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-1.34□□□□□ -2.62
NEB-212ENST00000483418 CDH23Q9H251 3354 aa-1.34□□□□□ -2.62
NEB-212ENST00000483418 PRCDQ00LT1 54 aa-1.37□□□□□ -2.63
NEB-212ENST00000483418 VPS13AQ96RL7 3174 aa-1.39□□□□□ -2.63
NEB-212ENST00000483418 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-1.42□□□□□ -2.64
NEB-212ENST00000483418 A0A096LPF7 62 aa-1.43□□□□□ -2.64
NEB-212ENST00000483418 APELAP0DMC3 54 aa-1.43□□□□□ -2.64
NEB-212ENST00000483418 Q9Y3F1 56 aa-1.52□□□□□ -2.65
NEB-212ENST00000483418 UTRNP46939 3433 aa-1.53□□□□□ -2.65
NEB-212ENST00000483418 HTN3P15516 51 aa-1.53□□□□□ -2.65
NEB-212ENST00000483418 RPL39P5Q59GN2 51 aa-1.54□□□□□ -2.66
NEB-212ENST00000483418 DEFB108AA8MXU0 73 aa-1.58□□□□□ -2.66
NEB-212ENST00000483418 H3BSH0 61 aa-1.58□□□□□ -2.66
NEB-212ENST00000483418 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
NEB-212ENST00000483418 COX14Q96I36 57 aa-1.68□□□□□ -2.68
NEB-212ENST00000483418 DEFB108BQ8NET1 73 aa-1.76□□□□□ -2.69
NEB-212ENST00000483418 STATHP02808 62 aa-2.04□□□□□ -2.74
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms