RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439578.5

SAR1B-202, Transcript of secretion associated Ras related GTPase 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAR1B, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1B-202ENST00000439578 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.3□□□□□ -1.72
SAR1B-202ENST00000439578 TNP1P09430 55 aa4.26□□□□□ -1.73
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.24□□□□□ -1.73
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP10-12P60413 245 aa4.23□□□□□ -1.73
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.23□□□□□ -1.73
SAR1B-202ENST00000439578 BRK1Q8WUW1 75 aa4.19□□□□□ -1.74
SAR1B-202ENST00000439578 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.19□□□□□ -1.74
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.15□□□□□ -1.75
SAR1B-202ENST00000439578 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.14□□□□□ -1.75
SAR1B-202ENST00000439578 KMT2DO14686 5537 aa4.13□□□□□ -1.75
SAR1B-202ENST00000439578 ROMO1P60602 79 aa4.12□□□□□ -1.75
SAR1B-202ENST00000439578 NEBP20929 6669 aa4.06□□□□□ -1.76
SAR1B-202ENST00000439578 LCE3AQ5TA76 89 aa4.04□□□□□ -1.76
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.03□□□□□ -1.76
SAR1B-202ENST00000439578 SPRR2EP22531 72 aa4.02□□□□□ -1.77
SAR1B-202ENST00000439578 SPRR2BP35325 72 aa4.02□□□□□ -1.77
SAR1B-202ENST00000439578 SPRR2AP35326 72 aa4.02□□□□□ -1.77
SAR1B-202ENST00000439578 MUC12Q9UKN1 5478 aa4□□□□□ -1.77
SAR1B-202ENST00000439578 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.98□□□□□ -1.77
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.97□□□□□ -1.77
SAR1B-202ENST00000439578 PP632Q6XCG6 107 aa3.97□□□□□ -1.77
SAR1B-202ENST00000439578 PMAIP1Q13794 54 aa3.95□□□□□ -1.78
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.95□□□□□ -1.78
SAR1B-202ENST00000439578 MT1EP04732 61 aa3.94□□□□□ -1.78
SAR1B-202ENST00000439578 MDN1Q9NU22 5596 aa3.94□□□□□ -1.78
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP12-3P60328 96 aa3.92□□□□□ -1.78
SAR1B-202ENST00000439578 PRO0628Q9UI54 55 aa3.9□□□□□ -1.79
SAR1B-202ENST00000439578 SPRR2DP22532 72 aa3.89□□□□□ -1.79
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.87□□□□□ -1.79
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.86□□□□□ -1.79
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.83□□□□□ -1.8
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.83□□□□□ -1.8
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.83□□□□□ -1.8
SAR1B-202ENST00000439578 MT1GP13640 62 aa3.82□□□□□ -1.8
SAR1B-202ENST00000439578 MT1LQ93083 61 aa3.81□□□□□ -1.8
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.79□□□□□ -1.8
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.79□□□□□ -1.8
SAR1B-202ENST00000439578 MT1MQ8N339 61 aa3.73□□□□□ -1.81
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.69□□□□□ -1.82
SAR1B-202ENST00000439578 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.67□□□□□ -1.82
SAR1B-202ENST00000439578 PRAC1Q96KF2 57 aa3.65□□□□□ -1.83
SAR1B-202ENST00000439578 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.62□□□□□ -1.83
SAR1B-202ENST00000439578 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SAR1B-202ENST00000439578 A0A0A0MQY5 61 aa3.42□□□□□ -1.86
SAR1B-202ENST00000439578 MT3P25713 68 aa3.36□□□□□ -1.87
SAR1B-202ENST00000439578 MT4P47944 62 aa3.36□□□□□ -1.87
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP12-4P60329 112 aa3.32□□□□□ -1.88
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP5-8O75690 187 aa3.26□□□□□ -1.89
SAR1B-202ENST00000439578 MT1AP04731 61 aa3.26□□□□□ -1.89
SAR1B-202ENST00000439578 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.24□□□□□ -1.89
SAR1B-202ENST00000439578 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.21□□□□□ -1.9
SAR1B-202ENST00000439578 LUZP6Q538Z0 58 aa3.21□□□□□ -1.9
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.19□□□□□ -1.9
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.17□□□□□ -1.9
SAR1B-202ENST00000439578 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SAR1B-202ENST00000439578 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.13□□□□□ -1.91
SAR1B-202ENST00000439578 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.06□□□□□ -1.92
SAR1B-202ENST00000439578 LCE1FQ5T754 118 aa3.05□□□□□ -1.92
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.02□□□□□ -1.93
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.94□□□□□ -1.94
SAR1B-202ENST00000439578 LCE1CQ5T751 118 aa2.85□□□□□ -1.95
SAR1B-202ENST00000439578 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.85□□□□□ -1.95
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.8□□□□□ -1.96
SAR1B-202ENST00000439578 NDUFAF8A1L188 74 aa2.79□□□□□ -1.96
SAR1B-202ENST00000439578 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.71□□□□□ -1.98
SAR1B-202ENST00000439578 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.7□□□□□ -1.98
SAR1B-202ENST00000439578 MUC5ACP98088 5654 aa2.54□□□□□ -2
SAR1B-202ENST00000439578 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.51□□□□□ -2.01
SAR1B-202ENST00000439578 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SAR1B-202ENST00000439578 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
SAR1B-202ENST00000439578 INE1O15225 51 aa2.34□□□□□ -2.03
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.12□□□□□ -2.07
SAR1B-202ENST00000439578 PRM1P04553 51 aa2.1□□□□□ -2.07
SAR1B-202ENST00000439578 PHGR1C9JFL3 82 aa1.87□□□□□ -2.11
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.33□□□□□ -2.2
SAR1B-202ENST00000439578 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 7 ms