RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q8IZM0 81 aa2.67□□□□□ -1.98
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.64□□□□□ -1.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP12-2P59991 146 aa2.63□□□□□ -1.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.63□□□□□ -1.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa2.62□□□□□ -1.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMIM2Q9BVW6 85 aa2.61□□□□□ -1.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPRR2EP22531 72 aa2.59□□□□□ -2
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPRR1AP35321 89 aa2.59□□□□□ -2
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPRR2BP35325 72 aa2.59□□□□□ -2
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPRR2AP35326 72 aa2.59□□□□□ -2
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.59□□□□□ -2
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00575Q6W349 94 aa2.57□□□□□ -2
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.55□□□□□ -2
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00158P58513 81 aa2.54□□□□□ -2
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.53□□□□□ -2
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRIPTQ9P021 101 aa2.52□□□□□ -2.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPRR2DP22532 72 aa2.5□□□□□ -2.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.5□□□□□ -2.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MT1BP07438 61 aa2.49□□□□□ -2.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00308Q8TCZ7 52 aa2.49□□□□□ -2.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.49□□□□□ -2.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPRR1BP22528 89 aa2.48□□□□□ -2.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP5-8O75690 187 aa2.45□□□□□ -2.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.44□□□□□ -2.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 K7EQZ3 153 aa2.44□□□□□ -2.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.42□□□□□ -2.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.41□□□□□ -2.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa2.41□□□□□ -2.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.41□□□□□ -2.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.37□□□□□ -2.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.36□□□□□ -2.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.36□□□□□ -2.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.34□□□□□ -2.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H0YAA0 97 aa2.32□□□□□ -2.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.31□□□□□ -2.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.31□□□□□ -2.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WFDC13Q8IUB5 93 aa2.3□□□□□ -2.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCE3AQ5TA76 89 aa2.29□□□□□ -2.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP12-1P59990 96 aa2.28□□□□□ -2.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.27□□□□□ -2.05
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MT4P47944 62 aa2.25□□□□□ -2.05
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MT1XP80297 61 aa2.23□□□□□ -2.05
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.23□□□□□ -2.05
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.21□□□□□ -2.06
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP12-4P60329 112 aa2.08□□□□□ -2.08
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 S4R3F8 94 aa2.08□□□□□ -2.08
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.06□□□□□ -2.08
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.04□□□□□ -2.08
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUC5ACP98088 5654 aa2.04□□□□□ -2.08
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A0D9SG42 100 aa2.02□□□□□ -2.09
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MT1EP04732 61 aa2□□□□□ -2.09
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2□□□□□ -2.09
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCE1CQ5T751 118 aa2□□□□□ -2.09
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCE1BQ5T7P3 118 aa2□□□□□ -2.09
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.99□□□□□ -2.09
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MT1MQ8N339 61 aa1.94□□□□□ -2.1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MT1GP13640 62 aa1.91□□□□□ -2.1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 M0QZ58 72 aa1.85□□□□□ -2.11
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa1.84□□□□□ -2.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MT1LQ93083 61 aa1.84□□□□□ -2.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP12-3P60328 96 aa1.82□□□□□ -2.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.62□□□□□ -2.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.59□□□□□ -2.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.59□□□□□ -2.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MT1AP04731 61 aa1.54□□□□□ -2.16
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNP1P09430 55 aa1.51□□□□□ -2.17
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.42□□□□□ -2.18
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PHGR1C9JFL3 82 aa1.39□□□□□ -2.19
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRM1P04553 51 aa1.35□□□□□ -2.19
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.09□□□□□ -2.23
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.1 ms