RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 LCE1DQ5T752 114 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP10-5P60370 271 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-206ENST00000413409 SPRR2EP22531 72 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-206ENST00000413409 SPRR2BP35325 72 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-206ENST00000413409 SPRR2AP35326 72 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-206ENST00000413409 PP632Q6XCG6 107 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-206ENST00000413409 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-206ENST00000413409 TNP1P09430 55 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-206ENST00000413409 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-206ENST00000413409 SPRR2DP22532 72 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-206ENST00000413409 MT1XP80297 61 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-206ENST00000413409 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-206ENST00000413409 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-206ENST00000413409 LCE3AQ5TA76 89 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-206ENST00000413409 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP10-12P60413 245 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRC-206ENST00000413409 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP12-3P60328 96 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-206ENST00000413409 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-206ENST00000413409 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-206ENST00000413409 NDUFAF8A1L188 74 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-206ENST00000413409 LUZP6Q538Z0 58 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-206ENST00000413409 MT4P47944 62 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-206ENST00000413409 MT1EP04732 61 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-206ENST00000413409 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-206ENST00000413409 MT1LQ93083 61 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-206ENST00000413409 A0A0A0MQY5 61 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-206ENST00000413409 MT1GP13640 62 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-206ENST00000413409 MT1MQ8N339 61 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-206ENST00000413409 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-206ENST00000413409 MUC5ACP98088 5654 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-206ENST00000413409 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-206ENST00000413409 INE1O15225 51 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP12-4P60329 112 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-206ENST00000413409 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP5-8O75690 187 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-206ENST00000413409 MT1AP04731 61 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-206ENST00000413409 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-206ENST00000413409 MT3P25713 68 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-206ENST00000413409 LCE1FQ5T754 118 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-206ENST00000413409 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-206ENST00000413409 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-206ENST00000413409 LCE1EQ5T753 118 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-206ENST00000413409 PRM1P04553 51 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-206ENST00000413409 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-206ENST00000413409 LCE1CQ5T751 118 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-206ENST00000413409 PHGR1C9JFL3 82 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-206ENST00000413409 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-206ENST00000413409 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-206ENST00000413409 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.12□□□□□ -2.07
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