RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEFB108AA8MXU0 73 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 CEP250Q9BV73 2442 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 SZT2Q5T011 3432 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 FRYLO94915 3013 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 XIRP2A4UGR9 3374 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEFB133Q30KQ1 61 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 RYR3Q15413 4870 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 CEP295Q9C0D2 2601 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEFB4AO15263 64 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 HTN1P15515 57 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 EYSQ5T1H1 3165 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP34Q70CQ2 3546 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 APELAP0DMC3 54 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 MT1GP13640 62 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 MT1MQ8N339 61 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-272P-201ENST00000411028 MT2AP02795 61 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 MT4P47944 62 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 FREM2Q5SZK8 3169 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 MYO9AB2RTY4 2548 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 RYR2Q92736 4967 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 LINC01556Q5JQF7 62 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 ASPMQ8IZT6 3477 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 CENPEQ02224 2701 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 CD52P31358 61 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCNTO95613 3336 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPR98Q8WXG9 6306 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 LOC400499M0QZD8 3231 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A096LPF7 62 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 NEBP20929 6669 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.16□□□□□ -2.43
RNU6-272P-201ENST00000411028 Q9Y3F1 56 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-272P-201ENST00000411028 UNC80Q8N2C7 3258 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-272P-201ENST00000411028 CEP350Q5VT06 3117 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-272P-201ENST00000411028 UTRNP46939 3433 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-272P-201ENST00000411028 MT1BP07438 61 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-272P-201ENST00000411028 EP400Q96L91 3159 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-272P-201ENST00000411028 BRCA2P51587 3418 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-272P-201ENST00000411028 VCANP13611 3396 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-272P-201ENST00000411028 MT1FP04733 61 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEFB108BQ8NET1 73 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-272P-201ENST00000411028 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPEGQ15772 3267 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-272P-201ENST00000411028 STATHP02808 62 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-272P-201ENST00000411028 COX14Q96I36 57 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-272P-201ENST00000411028 VPS13AQ96RL7 3174 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-272P-201ENST00000411028 HTN3P15516 51 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-272P-201ENST00000411028 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-272P-201ENST00000411028 CENPFP49454 3210 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDH23Q9H251 3354 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.43□□□□□ -2.48
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms