RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE4AQ5TA78 99 aa5.92□□□□□ -1.46
PGGT1B-202ENST00000379615 K7ERS5 55 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-202ENST00000379615 SPRR2DP22532 72 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TNP1P09430 55 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1B-202ENST00000379615 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1B-202ENST00000379615 A6NED7 52 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.74□□□□□ -1.49
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0A0MQY5 61 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-202ENST00000379615 MT1EP04732 61 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE3AQ5TA76 89 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-202ENST00000379615 MT1GP13640 62 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-202ENST00000379615 PP632Q6XCG6 107 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP12-3P60328 96 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-202ENST00000379615 MT1LQ93083 61 aa5.49□□□□□ -1.53
PGGT1B-202ENST00000379615 ROMO1P60602 79 aa5.46□□□□□ -1.54
PGGT1B-202ENST00000379615 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PGGT1B-202ENST00000379615 MT1MQ8N339 61 aa5.4□□□□□ -1.54
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-202ENST00000379615 BRK1Q8WUW1 75 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-202ENST00000379615 MT4P47944 62 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-202ENST00000379615 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-202ENST00000379615 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-202ENST00000379615 PMAIP1Q13794 54 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP12-4P60329 112 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-202ENST00000379615 PRO0628Q9UI54 55 aa4.79□□□□□ -1.64
PGGT1B-202ENST00000379615 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.75□□□□□ -1.65
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.71□□□□□ -1.66
PGGT1B-202ENST00000379615 PRAC1Q96KF2 57 aa4.71□□□□□ -1.66
PGGT1B-202ENST00000379615 MT1AP04731 61 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-202ENST00000379615 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-202ENST00000379615 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.42□□□□□ -1.7
PGGT1B-202ENST00000379615 MT3P25713 68 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFAF8A1L188 74 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP5-8O75690 187 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-202ENST00000379615 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.15□□□□□ -1.75
PGGT1B-202ENST00000379615 MUC5ACP98088 5654 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE1FQ5T754 118 aa4.07□□□□□ -1.76
PGGT1B-202ENST00000379615 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
PGGT1B-202ENST00000379615 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PGGT1B-202ENST00000379615 LUZP6Q538Z0 58 aa4.03□□□□□ -1.76
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE1EQ5T753 118 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE1CQ5T751 118 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-202ENST00000379615 PHGR1C9JFL3 82 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-202ENST00000379615 INE1O15225 51 aa2.81□□□□□ -1.96
PGGT1B-202ENST00000379615 PRM1P04553 51 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-202ENST00000379615 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.52□□□□□ -2.01
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.18□□□□□ -2.06
PGGT1B-202ENST00000379615 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.83□□□□□ -2.12
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