RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.18□□□□□ -1.9
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1B0GU69 56 aa3.17□□□□□ -1.9
CTXN3-201ENST00000379445 MT1BP07438 61 aa3.16□□□□□ -1.9
CTXN3-201ENST00000379445 ACYP2P14621 99 aa3.16□□□□□ -1.9
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.14□□□□□ -1.91
CTXN3-201ENST00000379445 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.13□□□□□ -1.91
CTXN3-201ENST00000379445 LCE1FQ5T754 118 aa3.12□□□□□ -1.91
CTXN3-201ENST00000379445 S4R3F8 94 aa3.11□□□□□ -1.91
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP10-5P60370 271 aa3.1□□□□□ -1.91
CTXN3-201ENST00000379445 MDN1Q9NU22 5596 aa3.08□□□□□ -1.92
CTXN3-201ENST00000379445 KMT2DO14686 5537 aa3.07□□□□□ -1.92
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.04□□□□□ -1.92
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.03□□□□□ -1.92
CTXN3-201ENST00000379445 CRIPTQ9P021 101 aa3.01□□□□□ -1.93
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3□□□□□ -1.93
CTXN3-201ENST00000379445 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.99□□□□□ -1.93
CTXN3-201ENST00000379445 H0YAA0 97 aa2.97□□□□□ -1.93
CTXN3-201ENST00000379445 INE1O15225 51 aa2.97□□□□□ -1.93
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP10-12P60413 245 aa2.95□□□□□ -1.94
CTXN3-201ENST00000379445 MT1XP80297 61 aa2.94□□□□□ -1.94
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.92□□□□□ -1.94
CTXN3-201ENST00000379445 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.92□□□□□ -1.94
CTXN3-201ENST00000379445 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.92□□□□□ -1.94
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.92□□□□□ -1.94
CTXN3-201ENST00000379445 SPRR2EP22531 72 aa2.9□□□□□ -1.95
CTXN3-201ENST00000379445 SPRR2BP35325 72 aa2.9□□□□□ -1.95
CTXN3-201ENST00000379445 SPRR2AP35326 72 aa2.9□□□□□ -1.95
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP12-2P59991 146 aa2.88□□□□□ -1.95
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP5-8O75690 187 aa2.87□□□□□ -1.95
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.87□□□□□ -1.95
CTXN3-201ENST00000379445 PLAC4Q8WY50 150 aa2.85□□□□□ -1.95
CTXN3-201ENST00000379445 PP632Q6XCG6 107 aa2.82□□□□□ -1.96
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.82□□□□□ -1.96
CTXN3-201ENST00000379445 M0QZ58 72 aa2.82□□□□□ -1.96
CTXN3-201ENST00000379445 SPRR2DP22532 72 aa2.8□□□□□ -1.96
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.76□□□□□ -1.97
CTXN3-201ENST00000379445 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.75□□□□□ -1.97
CTXN3-201ENST00000379445 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.71□□□□□ -1.98
CTXN3-201ENST00000379445 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
CTXN3-201ENST00000379445 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.68□□□□□ -1.98
CTXN3-201ENST00000379445 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.68□□□□□ -1.98
CTXN3-201ENST00000379445 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.67□□□□□ -1.98
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.63□□□□□ -1.99
CTXN3-201ENST00000379445 A0A0D9SG42 100 aa2.61□□□□□ -1.99
CTXN3-201ENST00000379445 MT1EP04732 61 aa2.6□□□□□ -1.99
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP12-1P59990 96 aa2.6□□□□□ -1.99
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.6□□□□□ -1.99
CTXN3-201ENST00000379445 MT1GP13640 62 aa2.51□□□□□ -2.01
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.51□□□□□ -2.01
CTXN3-201ENST00000379445 LCE3AQ5TA76 89 aa2.51□□□□□ -2.01
CTXN3-201ENST00000379445 MT1MQ8N339 61 aa2.48□□□□□ -2.01
CTXN3-201ENST00000379445 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.47□□□□□ -2.01
CTXN3-201ENST00000379445 MT1LQ93083 61 aa2.47□□□□□ -2.01
CTXN3-201ENST00000379445 MT4P47944 62 aa2.46□□□□□ -2.02
CTXN3-201ENST00000379445 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.44□□□□□ -2.02
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.4□□□□□ -2.03
CTXN3-201ENST00000379445 TNP1P09430 55 aa2.37□□□□□ -2.03
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP12-3P60328 96 aa2.31□□□□□ -2.04
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.31□□□□□ -2.04
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.3□□□□□ -2.04
CTXN3-201ENST00000379445 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP12-4P60329 112 aa2.26□□□□□ -2.05
CTXN3-201ENST00000379445 LCE1CQ5T751 118 aa2.22□□□□□ -2.05
CTXN3-201ENST00000379445 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.22□□□□□ -2.05
CTXN3-201ENST00000379445 MT1AP04731 61 aa2.1□□□□□ -2.07
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.09□□□□□ -2.07
CTXN3-201ENST00000379445 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
CTXN3-201ENST00000379445 MUC5ACP98088 5654 aa2.06□□□□□ -2.08
CTXN3-201ENST00000379445 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.01□□□□□ -2.09
CTXN3-201ENST00000379445 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.84□□□□□ -2.11
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.61□□□□□ -2.15
CTXN3-201ENST00000379445 PRM1P04553 51 aa1.55□□□□□ -2.16
CTXN3-201ENST00000379445 PHGR1C9JFL3 82 aa1.39□□□□□ -2.19
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.07□□□□□ -2.24
CTXN3-201ENST00000379445 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.87□□□□□ -2.27
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