RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 MDN1Q9NU22 5596 aa4.97□□□□□ -1.61
CNMD-201ENST00000377962 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.96□□□□□ -1.62
CNMD-201ENST00000377962 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.95□□□□□ -1.62
CNMD-201ENST00000377962 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.9□□□□□ -1.62
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.88□□□□□ -1.63
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.88□□□□□ -1.63
CNMD-201ENST00000377962 TNP1P09430 55 aa4.85□□□□□ -1.63
CNMD-201ENST00000377962 BRK1Q8WUW1 75 aa4.85□□□□□ -1.63
CNMD-201ENST00000377962 SPRR2EP22531 72 aa4.84□□□□□ -1.63
CNMD-201ENST00000377962 SPRR2BP35325 72 aa4.84□□□□□ -1.63
CNMD-201ENST00000377962 SPRR2AP35326 72 aa4.84□□□□□ -1.63
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CNMD-201ENST00000377962 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.71□□□□□ -1.66
CNMD-201ENST00000377962 LCE3AQ5TA76 89 aa4.71□□□□□ -1.66
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.69□□□□□ -1.66
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.69□□□□□ -1.66
CNMD-201ENST00000377962 SPRR2DP22532 72 aa4.67□□□□□ -1.66
CNMD-201ENST00000377962 MT1EP04732 61 aa4.64□□□□□ -1.67
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.64□□□□□ -1.67
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CNMD-201ENST00000377962 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.55□□□□□ -1.68
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CNMD-201ENST00000377962 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.52□□□□□ -1.69
CNMD-201ENST00000377962 PP632Q6XCG6 107 aa4.51□□□□□ -1.69
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CNMD-201ENST00000377962 MT1GP13640 62 aa4.46□□□□□ -1.7
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CNMD-201ENST00000377962 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
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CNMD-201ENST00000377962 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.07□□□□□ -1.76
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CNMD-201ENST00000377962 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.97□□□□□ -1.77
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.97□□□□□ -1.77
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.94□□□□□ -1.78
CNMD-201ENST00000377962 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.86□□□□□ -1.79
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.85□□□□□ -1.79
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP12-4P60329 112 aa3.83□□□□□ -1.8
CNMD-201ENST00000377962 MT1AP04731 61 aa3.79□□□□□ -1.8
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.79□□□□□ -1.8
CNMD-201ENST00000377962 LCE1FQ5T754 118 aa3.78□□□□□ -1.8
CNMD-201ENST00000377962 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.78□□□□□ -1.8
CNMD-201ENST00000377962 A0A0A0MQY5 61 aa3.71□□□□□ -1.82
CNMD-201ENST00000377962 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CNMD-201ENST00000377962 LUZP6Q538Z0 58 aa3.61□□□□□ -1.83
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.61□□□□□ -1.83
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.59□□□□□ -1.84
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CNMD-201ENST00000377962 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CNMD-201ENST00000377962 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.51□□□□□ -1.85
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP5-8O75690 187 aa3.36□□□□□ -1.87
CNMD-201ENST00000377962 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.28□□□□□ -1.88
CNMD-201ENST00000377962 NDUFAF8A1L188 74 aa3.26□□□□□ -1.89
CNMD-201ENST00000377962 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.11□□□□□ -1.91
CNMD-201ENST00000377962 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.97□□□□□ -1.93
CNMD-201ENST00000377962 LCE1CQ5T751 118 aa2.88□□□□□ -1.95
CNMD-201ENST00000377962 INE1O15225 51 aa2.76□□□□□ -1.97
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.49□□□□□ -2.01
CNMD-201ENST00000377962 PRM1P04553 51 aa2.45□□□□□ -2.02
CNMD-201ENST00000377962 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.41□□□□□ -2.02
CNMD-201ENST00000377962 PHGR1C9JFL3 82 aa2.39□□□□□ -2.03
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.81□□□□□ -2.12
CNMD-201ENST00000377962 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.5□□□□□ -2.17
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