RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

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Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NFIC-211ENST00000641145 MT1HL1P0DM35 61 aa6.65□□□□□ -1.34
NFIC-211ENST00000641145 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.48□□□□□ -1.37
NFIC-211ENST00000641145 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.41□□□□□ -1.38
NFIC-211ENST00000641145 LYSTQ99698 3801 aa6.39□□□□□ -1.39
NFIC-211ENST00000641145 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.38□□□□□ -1.39
NFIC-211ENST00000641145 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.27□□□□□ -1.41
NFIC-211ENST00000641145 ANK2Q01484 3957 aa6.24□□□□□ -1.41
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
NFIC-211ENST00000641145 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
NFIC-211ENST00000641145 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.21□□□□□ -1.42
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.2□□□□□ -1.42
NFIC-211ENST00000641145 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.19□□□□□ -1.42
NFIC-211ENST00000641145 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.16□□□□□ -1.42
NFIC-211ENST00000641145 SPRR2EP22531 72 aa6.16□□□□□ -1.42
NFIC-211ENST00000641145 SPRR2BP35325 72 aa6.16□□□□□ -1.42
NFIC-211ENST00000641145 SPRR2AP35326 72 aa6.16□□□□□ -1.42
NFIC-211ENST00000641145 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.16□□□□□ -1.42
NFIC-211ENST00000641145 LCE3BQ5TA77 95 aa6.1□□□□□ -1.43
NFIC-211ENST00000641145 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.07□□□□□ -1.44
NFIC-211ENST00000641145 MT1HP80294 61 aa6.07□□□□□ -1.44
NFIC-211ENST00000641145 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.06□□□□□ -1.44
NFIC-211ENST00000641145 KMT2AQ03164 3969 aa6.05□□□□□ -1.44
NFIC-211ENST00000641145 DNAH2Q9P225 4427 aa6.03□□□□□ -1.44
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP12-4P60329 112 aa6.03□□□□□ -1.44
NFIC-211ENST00000641145 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.03□□□□□ -1.44
NFIC-211ENST00000641145 MT3P25713 68 aa6.02□□□□□ -1.45
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.01□□□□□ -1.45
NFIC-211ENST00000641145 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.99□□□□□ -1.45
NFIC-211ENST00000641145 SPRR2DP22532 72 aa5.98□□□□□ -1.45
NFIC-211ENST00000641145 LCE2BO14633 110 aa5.93□□□□□ -1.46
NFIC-211ENST00000641145 MT2AP02795 61 aa5.91□□□□□ -1.46
NFIC-211ENST00000641145 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.78□□□□□ -1.48
NFIC-211ENST00000641145 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.75□□□□□ -1.49
NFIC-211ENST00000641145 MT1FP04733 61 aa5.74□□□□□ -1.49
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.74□□□□□ -1.49
NFIC-211ENST00000641145 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.73□□□□□ -1.49
NFIC-211ENST00000641145 MT1GP13640 62 aa5.72□□□□□ -1.49
NFIC-211ENST00000641145 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.71□□□□□ -1.5
NFIC-211ENST00000641145 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
NFIC-211ENST00000641145 LCE2CQ5TA81 110 aa5.65□□□□□ -1.51
NFIC-211ENST00000641145 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.6□□□□□ -1.51
NFIC-211ENST00000641145 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.56□□□□□ -1.52
NFIC-211ENST00000641145 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
NFIC-211ENST00000641145 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
NFIC-211ENST00000641145 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
NFIC-211ENST00000641145 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.49□□□□□ -1.53
NFIC-211ENST00000641145 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.45□□□□□ -1.54
NFIC-211ENST00000641145 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
NFIC-211ENST00000641145 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.45□□□□□ -1.54
NFIC-211ENST00000641145 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.45□□□□□ -1.54
NFIC-211ENST00000641145 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.41□□□□□ -1.54
NFIC-211ENST00000641145 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.38□□□□□ -1.55
NFIC-211ENST00000641145 MT4P47944 62 aa5.33□□□□□ -1.56
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.3□□□□□ -1.56
NFIC-211ENST00000641145 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.3□□□□□ -1.56
NFIC-211ENST00000641145 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.28□□□□□ -1.56
NFIC-211ENST00000641145 MT1XP80297 61 aa5.27□□□□□ -1.57
NFIC-211ENST00000641145 PKHD1P08F94 4074 aa5.26□□□□□ -1.57
NFIC-211ENST00000641145 LCE1DQ5T752 114 aa5.23□□□□□ -1.57
NFIC-211ENST00000641145 PRM1P04553 51 aa5.22□□□□□ -1.57
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.22□□□□□ -1.57
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.18□□□□□ -1.58
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.18□□□□□ -1.58
NFIC-211ENST00000641145 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.17□□□□□ -1.58
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.15□□□□□ -1.58
NFIC-211ENST00000641145 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.09□□□□□ -1.59
NFIC-211ENST00000641145 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
NFIC-211ENST00000641145 MT1LQ93083 61 aa5.09□□□□□ -1.6
NFIC-211ENST00000641145 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.03□□□□□ -1.6
NFIC-211ENST00000641145 MT1BP07438 61 aa4.99□□□□□ -1.61
NFIC-211ENST00000641145 FAT1Q14517 4588 aa4.98□□□□□ -1.61
NFIC-211ENST00000641145 PKD1P98161 4303 aa4.95□□□□□ -1.62
NFIC-211ENST00000641145 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.91□□□□□ -1.62
NFIC-211ENST00000641145 TNXBP22105 4242 aa4.87□□□□□ -1.63
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.86□□□□□ -1.63
NFIC-211ENST00000641145 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.86□□□□□ -1.63
NFIC-211ENST00000641145 MYCBP2O75592 4640 aa4.86□□□□□ -1.63
NFIC-211ENST00000641145 MT1EP04732 61 aa4.85□□□□□ -1.63
NFIC-211ENST00000641145 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
NFIC-211ENST00000641145 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.84□□□□□ -1.63
NFIC-211ENST00000641145 LCE1CQ5T751 118 aa4.84□□□□□ -1.64
NFIC-211ENST00000641145 LCE1EQ5T753 118 aa4.84□□□□□ -1.64
NFIC-211ENST00000641145 LCE1FQ5T754 118 aa4.84□□□□□ -1.64
NFIC-211ENST00000641145 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.84□□□□□ -1.64
NFIC-211ENST00000641145 DNHD1Q96M86 4753 aa4.83□□□□□ -1.64
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.82□□□□□ -1.64
NFIC-211ENST00000641145 RYR1P21817 5038 aa4.81□□□□□ -1.64
NFIC-211ENST00000641145 MT1MQ8N339 61 aa4.78□□□□□ -1.64
NFIC-211ENST00000641145 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.74□□□□□ -1.65
NFIC-211ENST00000641145 HSPG2P98160 4391 aa4.72□□□□□ -1.65
NFIC-211ENST00000641145 RYR2Q92736 4967 aa4.71□□□□□ -1.65
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.69□□□□□ -1.66
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.68□□□□□ -1.66
NFIC-211ENST00000641145 RYR3Q15413 4870 aa4.65□□□□□ -1.67
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.64□□□□□ -1.67
NFIC-211ENST00000641145 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.62□□□□□ -1.67
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.56□□□□□ -1.68
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