RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640703.1

GLDC-222, Transcript of glycine decarboxylase, human

TSL 5

Gene GLDC, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GLDC-222	ENST00000640703		Q6ZSA8	131 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GLDC-222	ENST00000640703	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703		A0A1B0GU33	70 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703		A0A087WTM6	91 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GLDC-222	ENST00000640703	HSPG2	P98160	4391 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GLDC-222	ENST00000640703	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GLDC-222	ENST00000640703	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GLDC-222	ENST00000640703	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GLDC-222	ENST00000640703	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GLDC-222	ENST00000640703		A0A0A0MQY5	61 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GLDC-222	ENST00000640703	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GLDC-222	ENST00000640703	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GLDC-222	ENST00000640703		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GLDC-222	ENST00000640703	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GLDC-222	ENST00000640703	SPINK1	P00995	79 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GLDC-222	ENST00000640703	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GLDC-222	ENST00000640703	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.01	□□□□□ -1.77
GLDC-222	ENST00000640703	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.01	□□□□□ -1.77
GLDC-222	ENST00000640703	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.01	□□□□□ -1.77
GLDC-222	ENST00000640703	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4	□□□□□ -1.77
GLDC-222	ENST00000640703	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
GLDC-222	ENST00000640703	PKD1	P98161	4303 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GLDC-222	ENST00000640703	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
GLDC-222	ENST00000640703	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GLDC-222	ENST00000640703	TPRXL	Q17RH7	258 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GLDC-222	ENST00000640703	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
GLDC-222	ENST00000640703	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
GLDC-222	ENST00000640703	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		3.96	□□□□□ -1.78
GLDC-222	ENST00000640703	MYCBP2	O75592	4640 aa		3.95	□□□□□ -1.78
GLDC-222	ENST00000640703	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
GLDC-222	ENST00000640703	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		3.94	□□□□□ -1.78
GLDC-222	ENST00000640703		A0A1B0GVY2	172 aa		3.93	□□□□□ -1.78
GLDC-222	ENST00000640703	CRIPT	Q9P021	101 aa		3.93	□□□□□ -1.78
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		3.92	□□□□□ -1.78
GLDC-222	ENST00000640703	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GLDC-222	ENST00000640703	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GLDC-222	ENST00000640703	RNF213	Q63HN8	5207 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GLDC-222	ENST00000640703	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
GLDC-222	ENST00000640703	FAT1	Q14517	4588 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GLDC-222	ENST00000640703	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
GLDC-222	ENST00000640703	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.83	□□□□□ -1.8
GLDC-222	ENST00000640703		S4R3F8	94 aa		3.82	□□□□□ -1.8
GLDC-222	ENST00000640703	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		3.8	□□□□□ -1.8
GLDC-222	ENST00000640703	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.8	□□□□□ -1.8
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.79	□□□□□ -1.8
GLDC-222	ENST00000640703	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
GLDC-222	ENST00000640703		A0A0D9SG42	100 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.73	□□□□□ -1.81
GLDC-222	ENST00000640703		M0QZ58	72 aa		3.72	□□□□□ -1.81
GLDC-222	ENST00000640703	LRP2	P98164	4655 aa		3.71	□□□□□ -1.81
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.71	□□□□□ -1.82
GLDC-222	ENST00000640703	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		3.71	□□□□□ -1.82
GLDC-222	ENST00000640703	MUC2	Q02817	5179 aa		3.7	□□□□□ -1.82
GLDC-222	ENST00000640703	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
GLDC-222	ENST00000640703	PLAC4	Q8WY50	150 aa		3.69	□□□□□ -1.82
GLDC-222	ENST00000640703	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		3.66	□□□□□ -1.82
GLDC-222	ENST00000640703	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		3.66	□□□□□ -1.82
GLDC-222	ENST00000640703	C9orf92	A6NGG3	77 aa		3.64	□□□□□ -1.83
GLDC-222	ENST00000640703	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.64	□□□□□ -1.83
GLDC-222	ENST00000640703		Q5VSD8	79 aa		3.63	□□□□□ -1.83
GLDC-222	ENST00000640703	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		3.62	□□□□□ -1.83
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP10-1	P60331	282 aa		3.61	□□□□□ -1.83
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLDC-222	ENST00000640703	TNXB	P22105	4242 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLDC-222	ENST00000640703	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
GLDC-222	ENST00000640703	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GLDC-222	ENST00000640703	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
GLDC-222	ENST00000640703	MT3	P25713	68 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.47	□□□□□ -1.85
GLDC-222	ENST00000640703	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		3.46	□□□□□ -1.86
GLDC-222	ENST00000640703	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.46	□□□□□ -1.86
GLDC-222	ENST00000640703	LPA	P08519	4548 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
GLDC-222	ENST00000640703	INE1	O15225	51 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GLDC-222	ENST00000640703	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GLDC-222	ENST00000640703		R4GN34	69 aa		3.4	□□□□□ -1.87
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.36	□□□□□ -1.87
GLDC-222	ENST00000640703	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.35	□□□□□ -1.87
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
GLDC-222	ENST00000640703	TNP1	P09430	55 aa		3.29	□□□□□ -1.88
GLDC-222	ENST00000640703	MUC17	Q685J3	4493 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GLDC-222	ENST00000640703	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.14	□□□□□ -1.91
GLDC-222	ENST00000640703	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GLDC-222	ENST00000640703	USH2A	O75445	5202 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GLDC-222	ENST00000640703	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms